attaaaggtt tataccttcc caggtaacaa accaaccaac tttcgatctc ttgtagatct…
Untaian huruf yang tidak jelas itu adalah potongan dari sekuens DNA dari patogen virus yang dijuluki novel coronavirus 2019 (2019-nCoV), yang melanda Tiongkok dan membikin takut masyarakat seluruh dunia. Para ilmuwan secara terbuka membagikan sejumlah besar sekuens penuh virus yang terus bertambah dari pasien-53 pada account terakhir dalam Global Initiative on Sharing All Influenza Data database Influenza.
Genom virus ini sedang dipelajari secara intensif untuk mencoba memahami asal-usul 2019-nCoV dan bagaimana hal itu cocok dengan silsilah virus terkait yang ditemukan pada kelelawar dan spesies lain. Mereka juga telah memberikan informasi sekilas mengenai seperti apa virus baru ini secara fisik, bagaimana virus baru ini berubah, dan bagaimana virus baru ini akan berhenti berubah.
“Salah satu pesan terpenting yang bisa diperoleh [dari sekuens virus] adalah bahwa ada satu introduksi menginfeksi ke dalam tubuh manusia dan kemudian penyebaran dari manusia ke manusia,” kata Trevor Bedford, seorang spesialis bioinformatika di University of Washington and Fred Hutchinson Cancer Research Center. Peran Pasar Grosir Makanan Laut Huanan di Wuhan, Tiongkok, dalam menyebarkan 2019-nCoV tetap suram, meskipun sekuensnya yang dimaksud telah dikombinasikan dengan pengambilan sampel lingkungan pasar untuk mengetahui keberadaan virus. Hal ini dilakukan untuk mengklarifikasi peran awal pasar tsb dalam kejadian luar biasa ini. Kata kebanyakan peneliti juga meruntuhkan pendapat bahwa patogen berasal dari lembaga virologi di Wuhan.
Secara keseluruhan, 2019-nCoV memiliki hampir 29.000 basa nukleotida yang digunakan untuk instruksi genetik dalam menghasilkan virus. Meskipun gen virus tsb dalam bentuk RNA, para ilmuwan mengubah genom virus tsb menjadi DNA, dengan basa yang dikenal dalam singkatan sebagai A, T, C, dan G, sehingga akan lebih mudah untuk dipelajari. Banyak analisis sekuens 2019-nCoV telah muncul di virological.org , nextstrain.org , server pracetak seperti bioRxiv, dan bahkan dalam jurnal peer-review. Sharing sekuens DNA virus tsb yang dilakukan oleh peneliti Tiongkok memungkinkan laboratorium kesehatan masyarakat di seluruh dunia bisa mengembangkan diagnostik sendiri terhadap virus ini, yang sekarang telah ditemukan di 18 negara lain.
Ketika rangkaian 2019-nCoV pertama tersedia, para peneliti menempatkannya di pohon filogenetik dari virus korona yang dikenal — yang jumlahnya banyak dan menginfeksi banyak spesies — dan menemukan bahwa virus tsb paling dekat hubungannya dengan kerabat yang ditemukan pada kelelawar. Sebuah tim yang dipimpin oleh Shi Zheng-Li, seorang spesialis coronavirus di Institut Virologi Wuhan, melaporkan pada 23 Januari di bioRxi sekuens 2019-nCoV adalah 96,2% mirip dengan virus kelelawar dan memiliki 79,5% kesamaan dengan virus corona yang menyebabkan sindrom pernafasan akut yang parah (SARS), lebih dari 15 tahun yang lalu. Sekuens virus ini memberikan alasan yang kuat bahwa dalam kasus ini virus melompat ke manusia dari coronavirus dalam musang yang berbeda dari virus SARS manusia dengan sedikitnya 10 nukleotida. Itulah salah satu alasan mengapa banyak ilmuwan menduga ada spesies inang “perantara” —atau beberapa — antara kelelawar dan 2019-nCoV.
Menurut analisis Bedford sekuens koronavirus kelelawar yang disorot tim Shi Zheng-Li, dijuluki RaTG13, berbeda dari 2019-nCoV sejumlah hampir 1.100 nukleotida. Di nextstrain.org, sebuah situs yang ia dirikan bersama, Bedford telah membuat pohon keluarga coronavirus (contoh di bawah) yang mencakup urutan kelelawar, musang, SARS, dan 2019-nCoV.
Analisis Bedford terhadap RaTG13 dan 2019-nCoV menunjukkan bahwa kedua virus tersebut memiliki nenek moyang yang sama 25 hingga 65 tahun yang lalu, sebuah perkiraan yang ia dapatkan dengan menggabungkan perbedaan nukleotida antara virus dengan tingkat mutasi yang diduga dalam coronavirus lain. Jadi sepertinya butuh beberapa dekade bagi virus seperti RaTG13 bermutasi menjadi 2019-nCoV.
Middle East respiratory syndrome (MERS), penyakit manusia lain yang disebabkan oleh coronavirus, juga memiliki kaitan dengan virus kelelawar. Tetapi penelitian telah membangun sebuah kasus yang menarik bahwa itu melompat ke manusia dari unta. Dan pohon filogenetik dari tulisan ilmiah bioRxiv Shi membuat tautan MERS unta mudah dilihat.
Semakin lama virus beredar dalam populasi manusia, semakin banyak waktu untuk mengembangkan mutasi yang membedakan strain pada orang yang terinfeksi, dan mengingat bahwa urutan 2019-nCoV yang dianalisis hingga saat ini berbeda satu sama lain dengan paling banyak tujuh nukleotida, ini menunjukkan bahwa virus itu melompat ke manusia baru-baru ini. Tapi itu tetap menjadi misteri di mana hewan menyebarkan virus ke manusia. “Ada area abu-abu yang sangat besar antara virus yang terdeteksi pada kelelawar dan virus yang sekarang diisolasi pada manusia,” kata Vincent Munster, seorang ahli virus di Institut Nasional Alergi dan Penyakit Menular AS yang mempelajari virus corona pada kelelawar, unta, dan spesies lainnya.
Bukti kuat menunjukkan bahwa pasar memainkan peran awal dalam penyebaran 2019-nCoV, tetapi apakah itu asal mula wabah masih belum pasti. Banyak kasus 2019-nCoV yang awalnya dikonfirmasi — 27 dari 41 yang pertama dalam satu laporan , 26 dari 47 dalam laporan lain— terhubung ke pasar Wuhan, tetapi hingga 45%, tidak termasuk segelintir yang paling awal. Ini menimbulkan kemungkinan bahwa lompatan awal ke manusia terjadi di tempat lain .
Menurut Xinhua , kantor berita milik pemerintah, "pengambilan sampel lingkungan" dari pasar makanan laut Wuhan telah menemukan bukti 2019-nCoV. Dari 585 sampel yang diuji, 33 positif untuk 2019-nCoV dan semua berada di bagian barat pasar besar, yang merupakan tempat penjualan satwa liar. "Tes positif dari pasar basah sangat penting," kata Edward Holmes, ahli biologi evolusi di University of Sydney yang bekerja sama dengan kelompok pertama yang secara publik merilis rangkaian 2019-nCoV di depan umum. “Tingkat tes positif yang tinggi akan sangat menyiratkan bahwa hewan di pasar memainkan peran kunci dalam munculnya virus.”
Namun belum ada pracetak atau laporan ilmiah resmi tentang pengambilan sampel, jadi tidak jelas hewan mana yang diuji positif. "Sampai anda secara konsisten mengisolasi virus dari satu spesies, sungguh, sangat sulit untuk mencoba dan menentukan apa inang alaminya," kata Kristian Andersen, ahli biologi evolusi di Scripps Research.
Satu penjelasan yang mungkin untuk kebingungan tentang di mana virus pertama kali masuk manusia adalah jika ada sekelompok hewan yang baru terinfeksi yang dijual di pasar yang berbeda. Atau pedagang hewan yang terinfeksi bisa menularkan virus ke orang yang berbeda di pasar yang berbeda. Atau, Bedford menyarankan, kasus-kasus awal itu bisa saja terinfeksi oleh virus yang tidak mudah ditularkan dan terputud-putus. "Akan sangat membantu untuk memiliki hanya satu sekuens atau dua sekuens virus dari tempat pasar [pengambilan sampel lingkungan] yang dapat membuat terang berapa banyak zoonosis yang terjadi dan kapan zoonosis terjadi," kata Bedford.
Dengan tidak adanya kesimpulan yang jelas tentang asal-usul wabah, teori berkembang, dan beberapa secara ilmiah goyah. Analisis sekuens yang dipimpin oleh Wei Ji dari Universitas Peking dan dipublikasikan secara online oleh Journal of Medical Virology menerima liputan pers yang besar ketika menyarankan bahwa "ular adalah reservoir hewan satwa liar yang paling mungkin untuk 2019-nCoV." Spesialis sekuens menyimpulkannya.
Teori konspirasi juga banyak. Sebuah laporan CBC News tentang pemerintah Kanada mendeportasi ilmuwan Tiongkok yang bekerja di laboratorium Winnipeg yang mempelajari patogen berbahaya terdistorsi di media sosial untuk menyarankan bahwa mereka adalah mata-mata yang telah menyelundupkan virus corona. Institut Virologi Wuhan, yang merupakan laboratorium utama di Tiongkok yang mempelajari virus kelelawar dan manusia, juga mendapat kecaman. "Para ahli menyanggah teori pinggiran yang menghubungkan coronavirus Tiongkok dengan penelitian senjata," membaca sebuah berita utama di sebuah cerita di The Washington Post yang berfokus pada fasilitas itu.
Kekhawatiran tentang lembaga ini sebelum wabah ini. Nature menerbitkan sebuah cerita pada tahun 2017 tentang hal itu membangun laboratorium tingkat keamanan hayati 4 (BSL4) baru dan termasuk ahli biologi molekuler Richard Ebright dari Rutgers University, Piscataway, mengungkapkan kekhawatiran tentang infeksi yang tidak disengaja, yang dia perhatikan berulang kali terjadi dengan pekerja laboratorium yang menangani SARS di Beijing. Ebright, yang memiliki sejarah panjang mengibarkan bendera merah tentang studi dengan patogen berbahaya, juga pada 2015 mengkritik percobaan di mana modifikasi dibuat untuk virus mirip SARS yang beredar di kelelawar Cina untuk melihat apakah itu berpotensi menyebabkan penyakit pada manusia. Awal pekan ini, Ebright mempertanyakan keakuratannya perhitungan Bedford bahwa setidaknya ada 25 tahun jarak evolusi antara RaTG13 — virus yang disimpan di lembaga virologi Wuhan — dan 2019-nCoV, dengan alasan bahwa tingkat mutasi mungkin berbeda ketika melewati host yang berbeda sebelum manusia. Ebright mengatakan kepada Science Insider bahwa data 2019-nCoV adalah "konsisten dengan masuk ke populasi manusia baik sebagai kecelakaan alami atau kecelakaan laboratorium."
Shi tidak membalas email dari Science , tetapi kolaboratornya yang lama, ahli ekologi penyakit Peter Daszak dari EcoHealth Alliance, menolak dugaan Ebright. "Setiap kali ada penyakit yang muncul, virus baru, cerita yang sama muncul: Ini adalah spillover atau pelepasan agen atau virus bioteknologi," kata Daszak. “Itu memalukan.Tampaknya manusia tidak bisa menolak kontroversi dan mitos-mitos ini, namun itu menatap kita tepat di depan muka. Ada keanekaragaman virus yang luar biasa ini dalam satwa liar dan kami baru saja menggaruk permukaannya. Dalam keragaman itu, akan ada beberapa yang dapat menginfeksi orang dan dalam kelompok itu akan ada yang menyebabkan penyakit. "
Kelompok Daszak dan Shi selama 8 tahun telah menjebak kelelawar di gua-gua di sekitar China untuk mengambil sampel kotoran dan darah mereka dari virus. Dia mengatakan mereka telah mengambil sampel lebih dari 10.000 kelelawar dan 2000 spesies lainnya. Mereka telah menemukan sekitar 500 coronavirus baru, sekitar 50 di antaranya tergolong relatif dekat dengan virus SARS pada silsilah keluarga, termasuk RaTG13 — itu diambil dari sampel kotoran kelelawar yang mereka kumpulkan pada 2013 dari sebuah gua di Moglang di provinsi Yunnan. "Kami tidak dapat berasumsi bahwa hanya karena virus dari Yunnan ini memiliki identitas sekuens tinggi dengan yang baru yang merupakan asalnya," kata Daszak, mencatat bahwa hanya sebagian kecil dari virus corona yang menginfeksi kelelawar telah ditemukan.
Bukan hanya "berminat ingin tahu" untuk mencari tahu apa yang memicu wabah saat ini, kata Daszak. “Jika kita tidak menemukan asal-usul virusnya, itu masih bisa menjadi infeksi yang menyerang di sebuah peternakan di suatu tempat, dan mati sekali wabah terjadi, mungkin ada spillover lanjutan yang benar-benar sulit untuk dihentikan. Tapi Si Wasit masih belum tahu asal-usul sebenarnya virus ini. "
Sumber:
Mining coronavirus genomes for clues to the outbreak’s origins. Jon Cohen 31 Januari 2020, 18:20
Science.
Saturday, 7 March 2020
Menggali genom coronavirus untuk petunjuk asal wabah
Posted by Drh.Pudjiatmoko,PhD at 19:15 0 comments
Labels: coronavirus
Friday, 6 March 2020
Obat Tentatif SARS-CoV-2
Angiotensin receptor blocker sebagai Obat tentatif SARS-CoV-2
Pada saat menulis
komentar ini (Februari 2020), epidemi coronavirus COVID-19 telah mengakibatkan
lebih banyak kematian dibandingkan dengan gabungan epidemi koronavirus SARS dan
MERS. Namun bantuan untuk menahan cepatnya penyebarannya dan mengurangi angka
kematian yang tinggi sangat dibutuhkan. Mengembangkan vaksin untuk melawan
virus SARS-CoV-2 dapat memakan waktu berbulan-bulan. Selain itu, vaksin
berdasarkan peptida yang dikodekan oleh virus mungkin tidak efektif melawan
epidemi coronavirus di masa depan, karena mutasi virus dapat membuat upayanya
sia-sia. Memang, jenis virus influenza baru muncul setiap tahun, yang
membutuhkan imunisasi baru. Saran sementara berdasarkan terapi yang ada, yang
kemungkinan akan tahan terhadap mutasi coronavirus baru, adalah menggunakan
penghambat angiotensin 1 (AT1R) yang tersedia, seperti losartan, sebagai terapi
untuk mengurangi agresivitas dan mortalitas dari infeksi virus SARS-CoV-2 .
Gagasan ini
didasarkan pada pengamatan bahwa enzim pengonversi angiotensin 2 (ACE2) sangat
mungkin berfungsi sebagai tempat pengikatan untuk SARS-CoV-2, strain yang
terlibat dalam epidemi COVID-19 saat ini, mirip dengan strain SARS-CoV yang
terlibat dalam 2002-2003 epidemi SARS. Ulasan ini menguraikan gagasan untuk
mempertimbangkan AT1R blocker sebagai pengobatan sementara untuk infeksi
SARS-CoV-2, dan mengusulkan arahan penelitian berdasarkan pada pendataan
catatan pasien klinis untuk menilai kelayakannya.
Kata Kunci: angiotensin-converting
enzyme 2 (ACE2), AT1R blocker, COVID-19 epidemic, losartan, SARS-CoV-2
Latar Belakang
Pada saat
menulis komentar ini (Februari 2020), jumlah kematian akibat epidemi COVID-19
yang disebabkan oleh coronavirus SARS-CoV-2, yang muncul pada akhir Desember
2019 di Wuhan, Tiongkok (Organisasi Kesehatan Dunia/WHO, 2019), telah melampaui
gabungan angka kematian epidemi SARS tahun 2002-2003 dan epidemi MERS tahun
2013(Mahase, 2020). Epidemi ini tampaknya menyebar pada tingkat eksponensial,
dengan periode dua kali lipat 1,8 hari, dan pada waktu itu ada kekhawatiran
bahwa situasi ini mungkin akan berkembang menjadi skala pandemi (Cheng &
Shan, 2020). Namun, tidak ada terapi SARS-CoV-2 yang tersedia saat ini,
walaupun beberapa pilihan pengobatan yang menunggu validasi telah dipublikasikan,
termasuk beberapa antivirus spektrum luas seperti favipiravir dan remdesivir
(Beigel et al., 2019, Li & De Clercq, 2020), obat anti-malaria chloroquine
(Gao, Tian, & Yang, 2020), dan formula herbal tradisional Tiongkok (Luo
et al., 2020). Solusi utamanya adalah, jelas, mengembangkan vaksin SARS-CoV ‐ 2
(Patel et al., 2020; Zhang & Liu, 2020).
Namun, vaksin untuk SARS-CoV yang
dikembangkan sejak wabah 18 tahun yang lalu belum terwujud menjadi produk yang
disetujui secara resmi. Topik tersebut telah ditinjau secara rinci (de Wit, van
Doremalen, Falzarano, & Munster, 2016) dan berada di luar cakupan komentar
singkat ini. Selain itu, ada kekhawatiran tentang peningkatan penyakit akibat mediasi-vaksin,
misalnya, karena imunopatologi paru pada tantangan dengan SARS-CoV (Tseng et
al., 2012). Selain itu, bahkan setelah vaksin disetujui untuk digunakan untuk manusia,
tingkat mutasinya virus tinggi yang berarti vaksin baru mungkin perlu
dikembangkan untuk setiap wabah, mirip dengan situasi dengan vaksin influenza
tahunan baru (Belongia et al., 2017). Di bawah ini, dijelaskan pilihan
alternatif dimana apabila terbukti efektif, akan memungkinkan aplikasi yang
cepat di klinik.
Hipotesis
Sebuah
hipotesis baru-baru ini menyatakan bahwa inhibitor angiotensin receptor 1 (AT1R) mungkin bermanfaat untuk pasien yang
terinfeksi COVID-19 yang mengalami pneumonia (Sun, Yang, Sun, & Su, 2020). Namun, artikel tersebut hanya tersedia dalam
bahasa Mandarin dengan abstrak bahasa Inggris yang tidak menjelaskan alasan logisnya
selain gagasan bahwa sistem renin-angiotensin didysregulasi oleh SARS-CoV-2. Saran serupa yang mengusulkan
pengobatan COVID - 19 pasien dengan AT1R blocker diajukan dalam "rapid online response" yang
diposting secara online oleh British
Medical Journal pada 4 Februari 2020 (Phadke & Saunik, 2020). Saran
sementara ini didasarkan pada pengamatan bahwa SARS-CoV-2 menggunakan angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2)
sebagai receptor binding domain untuk
Spike protein (Lu et al., 2020; Wan,
Shang, Graham, Baric, & Li , 2020), mirip dengan strain coronavirus penyebab
timbulnya epidemi SARS 2002-2003 (Dimitrov, 2003; Ge et al., 2013; Li et al.,
2003; Prabakaran et al 2004; Turner, Hiscox, & Hooper, 2004) . Selain itu, receptor binding domain dari kedua virus
corona ini kesamaan 72% identitas urutan asam amino, dan simulasi molekuler
telah menunjukkan struktur 3D serupa (Chen, Guo, Pan, & Zhao, 2020). Namun,
SARS‐CoV‐2 berisi loop yang berbeda
dengan residu glikil yang fleksibel menggantikan residu prolyl yang kaku di
SARS‐CoV, dan pemodelan molekul menunjukkan bahwa receptor binding domain SARS‐CoV‐2 memiliki afinitas yang lebih
tinggi untuk ACE2 dibandingkan dengan SARS‐CoV ( Chen et al., 2020).
Khususnya, angiotensin-converting enzyme (ACE) dan homolog
dekatnya ACE2, sementara keduanya milik keluarga ACE dari dipeptidyl carboxydipeptidases, menyediakan dua fungsi fisiologis
yang berlawanan. ACE memecah angiotensin I untuk menghasilkan angiotensin II,
peptida yang mengikat dan mengaktifkan AT1R untuk menyempitkan pembuluh darah,
sehingga meningkatkan tekanan darah. Dengan mengkerut, ACE2 menonaktifkan
angiotensin II sambil menghasilkan angiotensin 1-7, sebuah heptapeptida yang
memiliki fungsi vasodilator yang kuat melalui aktivasi Mas receptor nya (Santos et al., 2003), dan dengan demikian
berfungsi sebagai regulator negatif dari sistem renin-angiotensin. Aksi berlawanan ACE dan ACE2 ini baru-baru ini
ditinjau oleh Smyth, Cañadas-Garre, Cappa, Maxwell, & McKnight, 2019.
Antagonis AT1R
losartan dan olmesartan, yang biasa digunakan untuk mengurangi tekanan darah
pada pasien hipertensi, terbukti meningkatkan ekspresi ACE2 jantung sekitar
tiga kali lipat setelah perawatan kronis (28 hari) setelah infark miokard yang
disebabkan oleh ligasi arteri koroner tikus (Ishiyama et al. , 2004). Losartan
juga terbukti meningkatkan ekspresi ACE2 ginjal pada tikus yang diobati secara
kronis (Klimas et al., 2015). Sesuai dengan pengamatan ini, kadar ACE2 urin
yang lebih tinggi diamati pada pasien hipertensi yang diobati dengan antagonis
AT1R olmesartan (Furuhashi et al., 2015). Secara keseluruhan, pengamatan ini
menunjukkan bahwa blokade AT1R terus menerus menghasilkan peningkatan ACE2 pada
tikus dan manusia.
Seperti
dijelaskan di atas, ACE2 adalah binding
site umum untuk SARS-CoV dari epidemi SARS 2002-2003 dan, kemungkinan
besar, juga strain SARS-CoV-2 yang mendasari epidemi COVID-19 saat ini. Oleh
karena itu, saran untuk mengobati pasien SARS dengan antagonis AT1R untuk
meningkatkan ekspresi ACE2 mereka tampaknya berlawanan dengan intuisi. Namun,
beberapa pengamatan dari studi tentang SARS-CoV, yang sangat mungkin relevan
juga untuk SARS-CoV-2, tampaknya menyarankan sebaliknya. Telah ditunjukkan
bahwa pengikatan Spike protein
coronavirus ke ACE2, tempat pengikatan selulernya, mengarah pada penurunan
regulasi ACE2, yang pada gilirannya menghasilkan produksi angiotensin yang
berlebihan oleh enzim ACE yang terkait, sementara lebih sedikit ACE2 yang mampu
mengubahnya menjadi vasodilator heptapeptide angiotensin 1-7. Ini pada
gilirannya berkontribusi terhadap cedera paru-paru, karena AT1R yang dirangsang
angiotensin menghasilkan peningkatan permeabilitas pembuluh darah paru,
sehingga memediasi peningkatan patologi paru-paru (Imai et al., 2005; Kuba et
al., 2005). Oleh karena itu, ekspresi ACE2 lebih tinggi setelah
dilakukan pengobatan terus dengan AT1R
blocker untuk pasien yang terinfeksi SARS-CoV-2, sementara tampaknya
paradoks, dapat melindungi mereka terhadap cedera paru-paru akut daripada
menempatkan mereka pada risiko yang lebih tinggi untuk perkembangan SARS. Ini
dapat dipertanggungjawabkan oleh dua mekanisme yang saling melengkapi:
menghalangi aktivasi AT1R yang dimediasi angiotensin berlebihan yang disebabkan
oleh infeksi virus, serta meningkatkan ACE2, sehingga mengurangi produksi
angiotensin oleh ACE dan meningkatkan produksi vasodilator angiotensin 1-7.
Aspek-aspek ini pada peran ACE2 yang tidak diregulasi dalam patogenesis
SARS-CoV ditinjau secara rinci oleh de Wit et al., 2016. Kebetulan, setelah
epidemi SARS-CoV tahun 2002-2003, ACE2 inhibitor disarankan sebagai terapi SARS
(Huentelman et al. ., 2004; Turner et al., 2004); Namun, proposal ini belum
mengarah ke obat baru.
Secara
kebetulan, dalam konteks human
immunodeficiency virus (HIV), telah ditunjukkan bahwa melindungi dari tingkat
ekspresi yang lebih tinggi dari binding
site HIV CCR5 dan CD4, bukannya meningkatkan, virulensi HIV. Michel et
al. melaporkan bahwa HIV menggunakan produk gen Nef awalnya untuk
menghindari superinfeksi selama langkah pemasukan virus dengan menurunkan
regulasi CCR5. Downregulasi yang
diperantarai Nef ini meningkatkan tingkat endositosis CCR5 dan CD4, yang pada
gilirannya memfasilitasi replikasi dan penyebaran HIV yang efisien, sehingga
mendorong patogenesis AIDS (Michel, Allespach, Venzke, Fackfmicheller, &
Keppler, 2005). Masih harus dipelajari jika mekanisme yang sebanding untuk
menghindari superinfeksi telah berevolusi dalam coronavirus; dalam hal ini,
saran untuk menerapkan pemblokir AT1R sebagai terapi SARS, bahkan jika mereka
meningkatkan ekspresi situs pengikatan virus ACE2, tidak akan tampak paradoks.
Penggunaan Angiotensin receptor
blocker
Losartan,
telmisartan, olmesartan (dan antagonis AT1R tambahan) secara luas diterapkan di
klinik sejak tahun 1990-an untuk mengendalikan hipertensi dan gangguan ginjal,
dan dikenal sebagai obat aman yang jarang terlibat dalam kejadian obat yang
merugikan (Deppe, Böger, Weiss, & Benndorf, 2010; McIntyre, Caffe,
Michalak, & Reid, 1997). Namun, harus dicatat bahwa sekitar setengah dari
pasien SARS-CoV menjadi hipotensi selama rawat inap mereka (Yu et al., 2006).
Pada saat menulis komentar ini, tidak ada informasi lengkap yang tersedia
tentang tingkat hipotensi di antara pasien SARS-CoV-2 yang dirawat di rumah
sakit; Oleh karena itu terlalu dini untuk memperkirakan berapa persen pasien
SARS dari epidemi yang sedang berlangsung dapat diobati dengan aman dengan AT1R
blocker tanpa risiko hipotensi yang diperburuk.
Saran sementara
untuk menerapkan antagonis AT1R seperti losartan dan telmisartan sebagai terapi
SARS-CoV-2 untuk merawat pasien sebelum pengembangan sindrom pernapasan akut
masih belum terbukti sampai dicoba. Pada saat menulis komentar singkat ini,
akhir dari epidemi COVID-19 tidak terlihat dan tindakan drastis diperlukan (dan
sedang dilakukan) untuk menahan penyebaran dan kematiannya. Oleh karena itu,
pendekatan yang paling cepat untuk menilai kelayakannya adalah dengan
menganalisis catatan pasien klinis dan menerapkan teknologi datamining untuk
menentukan apakah pasien yang diresepkan dengan antagonis AT1R sebelum diagnosis
mereka (untuk mengobati hipertensi, penyakit ginjal diabetes, atau indikasi
lainnya) lebih baik. hasil penyakit. Selain itu, persentase orang yang diobati
secara terus menerus dengan penghambat AT1R pada populasi umum harus
dibandingkan dengan persentase di antara pasien yang dirawat di rumah sakit
dari pasien yang terinfeksi SARS-CoV-2 yang menunjukkan gejala serius. Jika
persentase yang terakhir akan ditemukan secara signifikan lebih kecil, ini akan
mendukung gagasan bahwa antagonis AT1R memberikan perlindungan dari gejala
parah di antara individu yang terinfeksi SARS-CoV-2. Pengetahuan yang diperoleh
dari pengumpulan catatan klinis semacam itu tampaknya penting untuk mengurangi
mortalitas dan morbiditas SARS-CoV-2. Pada saat yang sama, upaya harus dilakukan
untuk mengembangkan vaksin SARS-CoV-2.
Daftar Pustaka
Beigel, J. H., Nam,
H. H., Adams, P. L., Krafft, A., Ince, W. L., ElKamary, S. S., & Sims,
A. C. (2019). Advances in respiratory virus therapeutics—A meeting report from
the 6th isirv Antiviral Group conference. Antiviral Research, 167, 45–67.
https://doi.org/10.1016/j. antiviral.2019.04.006
Belongia, E. A.,
Skowronski, D. M., McLean, H. Q., Chambers, C., Sundaram, M. E., & De
Serres, G. (2017). Repeated annual influenza vaccination and vaccine
effectiveness: Review of evidence. Expert Review of Vaccines, 16(7),
1–14. https://doi.org/10.1080/14760584.
2017.1334554
Chen, Y., Guo, Y.,
Pan, Y., & Zhao, Z. J. (2020). Structure analysis of the receptor
binding of 2019-nCoV. Biochemical and Biophysical Research Communications.
https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2020.02.071 [Epub ahead of print].
Cheng, Z. J.,
& Shan, J. (2020). 2019 Novel coronavirus: Where we are and what we
know. Infection. https://doi.org/10.1007/s15010-020- 01401-y [Epub ahead of
print].
Deppe, S., Böger, R.
H., Weiss, J., & Benndorf, R. A. (2010). Telmisartan: A review of its
pharmacodynamic and pharmacokinetic properties. Expert Opinion on Drug
Metabolism & Toxicology, 6(7), 863–871. https://doi.
org/10.1517/17425255.2010.494597
de Wit, E., van
Doremalen, N., Falzarano, D., & Munster, V. J. (2016). SARS and MERS:
Recent insights into emerging coronaviruses. Nature Reviews. Microbiology,
14(8), 523–534. https://doi.org/10.1038/ nrmicro.2016.81
Dimitrov, D. S.
(2003). The secret life of ACE2 as a receptor for the SARS virus. Cell, 115(6),
652–653.
Gao, J., Tian, Z.,
& Yang, X. (2020). Breakthrough: Chloroquine phosphate has shown
apparent efficacy in treatment of COVID-19 associated pneumonia in clinical
studies. Bioscience Trends. https://doi.org/10. 5582/bst.2020.01047 [Epub ahead
of print].
Furuhashi, M.,
Moniwa, N., Mita, T., Fuseya, T., Ishimura, S., Ohno, K., … Miura, T. (2015).
Urinary angiotensin-converting enzyme 2 in hypertensive patients may be
increased by olmesartan, an angiotensin II receptor blocker. American Journal
of Hypertension, 28(1), 15–21. https://doi.org/10.1093/ajh/hpu086
Ge, X. Y., Li, J. L.,
Yang, X. L., Chmura, A. A., Zhu, G., Epstein, J. H., … Shi, Z. L. (2013).
Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the
ACE2 receptor. Nature, 503(7477), 535–538. https://doi.org/10.1038/nature12711
Huentelman, M. J.,
Zubcevic, J., Hernández Prada, J. A., Xiao, X., Dimitrov, D. S., Raizada, M.
K., & Ostrov, D. A. (2004). Structure-based discovery of a novel
angiotensin-converting enzyme 2 inhibitor. Hypertension, 44(6), 903–906.
Imai, Y., Kuba, K.,
Rao, S., Huan, Y., Guo, F., Guan, B., … Penninger, J. M. (2005).
Angiotensin-converting enzyme 2 protects from severe acute lung failure.
Nature, 436(7047), 112–116.
Ishiyama, Y.,
Gallagher, P. E., Averill, D. B., Tallant, E. A., Brosnihan, K. B., &
Ferrario, C. M. (2004). Upregulation of angiotensin-converting enzyme 2 after
myocardial infarction by blockade of angiotensin II receptors. Hypertension,
43(5), 970–976.
Klimas, J., Olvedy,
M., Ochodnicka-Mackovicova, K., Kruzliak, P., Cacanyiova, S., Kristek, F., …
Ochodnicky, P. (2015). Perinatally administered losartan augments renal ACE2
expression but not cardiac or renal Mas receptor in spontaneously hypertensive
rats. Journal of Cellular and Molecular Medicine, 19(8), 1965–1974.
https://doi.org/10. 1111/jcmm.12573
Kuba, K., Imai, Y.,
Rao, S., Gao, H., Guo, F., Guan, B., … Penninger, J. M. (2005). A crucial role
of angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) in SARS coronavirus-induced lung
injury. Nature Medicine, 11(8), 875–879.
Li, G., & De
Clercq, E. (2020). Therapeutic options for the 2019 novel coronavirus
(2019-nCoV). Nat Rev Drug Discov. https://doi.org/10.1038/ d41573-020-00016-0.
[Epub ahead of print].
Li, W., Moore, M. J.,
Vasilieva, N., Sui, J., Wong, S. K., Berne, M. A., … Farzan, M. (2003).
Angiotensin-converting enzyme 2 is a functional receptor for the SARS
coronavirus. Nature, 426(6965), 450–454.
Lu, R., Zhao, X., Li,
J., Niu, P., Yang, B., Wu, H., et al. (2020). Genomic characterisation and
epidemiology of 2019 novel coronavirus: Implications for virus origins and
receptor binding. Lancet. https://doi.org/10. 1016/S0140-6736(20)30251-8 [Epub
ahead of print].
Luo, H., Tang, Q. L.,
Shang, Y. X., Liang, S. B., Yang, M., Robinson, N., & Liu, J. P.
(2020). Can Chinese medicine be used for prevention of Corona virus disease
2019 (COVID-19)? A review of historical classics, research evidence and current
prevention programs. Chinese Journal of Integrative Medicine.
https://doi.org/10.1007/s11655-020-3192-6 [Epub ahead of print].
Mahase, E. (2020).
Coronavirus covid-19 has killed more people than SARS and MERS combined,
despite lower case fatality rate. BMJ. https://doi. org/10.1136/bmj.m641
McIntyre, M., Caffe,
S. E., Michalak, R. A., & Reid, J. L. (1997). Losartan, an orally
active angiotensin (AT1) receptor antagonist: A review of its efficacy and
safety in essential hypertension. Pharmacology & Therapeutics, 74(2),
181–194.
Michel, N.,
Allespach, I., Venzke, S., Fackfmicheller, O. T., & Keppler, O. T.
(2005). The Nef protein of human immunodeficiency virus establishes
superinfection immunity by a dual strategy to downregulate cellsurface CCR5 and
CD4. Current Biology, 15(8), 714–723.
Patel, A., Jernigan,
D. B., & 2019-nCoV CDC Response Team. (2020). Initial public health
response and Interim clinical guidance for the 2019 Novel Coronavirus
Outbreak—United States, December 31, 2019-February 4, 2020. MMWR Morbidity and
Mortality Weekly Report, 69(5), 140–146. https://doi.org/10.15585/mmwr.mm6905e1
Phadke, M., &
Saunik, S. (2020). Rapid response: Use of angiotensin receptor blockers such as
Telmisartan, Losartsan in nCoV Wuhan Corona Virus infections—Novel mode of
treatment. Response to the emerging novel coronavirus outbreak. BMJ 2020, 368,
m406. https://doi.org/ 10.1136/bmj.m406
Prabakaran, P., Xiao,
X., & Dimitrov, D. S. (2004). A model of the ACE2 structure and
function as a SARS-CoV receptor. Biochemical and Biophysical Research
Communications, 314(1), 235–241.
Santos, R. A., Simoes
e Silva, A. C., Maric, C., Silva, D. M., Machado, R. P., de Buhr, I., … Walther,
T. (2003). Angiotensin-(1-7) is an endogenous ligand for the G protein-coupled
receptor Mas. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United
States of America, 100(14), 8258–8263.
Smyth, L. J.,
Cañadas-Garre, M., Cappa, R. C., Maxwell, A. P., & McKnight, A. J.
(2019). Genetic associations between genes in the renin–angiotensin–aldosterone
system and renal disease: A systematic review and meta-analysis. BMJ Open,
9(4), e026777. https://doi.org/ 10.1136/bmjopen-2018-026777
Sun, M. L., Yang, J.
M., Sun, Y. P., & Su, G. H. (2020). Inhibitors of RAS might be a good
choice for the therapy of COVID-19 pneumonia. Zhonghua Jie He He Hu Xi Za Zhi,
43(0), E014. https://doi.org/10.3760/cma.j.issn. 1001-0939.2020.0014 [Epub
ahead of print]. Chinese.
Tseng, C. T., Sbrana,
E., Iwata-Yoshikawa, N., Newman, P. C., Garron, T., Atmar, R. L., … Couch, R.
B. (2012). Immunization with SARS coronavirus vaccines leads to pulmonary
immunopathology on challenge with the SARS virus. PLoS One, 7(4), e35421.
https://doi.org/10. 1371/journal.pone.0035421
Turner, A. J.,
Hiscox, J. A., & Hooper, N. M. (2004). ACE2: from vasopeptidase to SARS
virus receptor. Trends in Pharmacological Sciences, 25(6), 291–294.
Wan, Y., Shang, J.,
Graham, R., Baric, R. S., & Li, F. (2020). Receptor recognition by
novel coronavirus from Wuhan: An analysis based on decade-long structural
studies of SARS. J Virol. https://doi.org/10. 1128/JVI.00127-20 [Epub ahead of
print]. World Health Organization. 2019. Coronavirus disease (COVID-19)
outbreak. https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019
Yu, C. M., Wong, R.
S., Wu, E. B., Kong, S. L., Wong, J., Yip, G. W., … Sung, J. J. (2006).
Cardiovascular complications of severe acute respiratory syndrome. Postgraduate
Medical Journal, 82(964), 140–144.
Zhang, L., &
Liu, Y. (2020). Potential Interventions for Novel Coronavirus in China: A
systematic review. Journal of Medical Virology. https://doi.
org/10.1002/jmv.25707 [Epub ahead of print].
Sumber:
David Gurwitz. 27
February 2020. Angiotensin receptor blockers as tentative SARS-CoV-2 Therapeutics. Commentary. Drug
Dev Res. 2020:1-4. DOI:10.1002/ddr.21656
Posted by Drh.Pudjiatmoko,PhD at 17:14 0 comments
Labels: coronavirus
Thursday, 5 March 2020
Rumah Sakit Rujukan COVID-19
100 Rumah Sakit Rujukan Coronavirus COVID-19 di Indonesia
*Aceh*
RSU Dr. Zainoel Abidin Banda Aceh
RSU Cut Meutia Lhokseumawe
*Sumatera Utara*
RSU H. Adam Malik Medan
RSU Kabanjahe
RSU Pematang Siantar
RSU Tarutung
RSU Padang Sidempuan
*Sumatera Barat*
RSU Dr. M. Jamil Padang
RSU Dr. Achmad Mochtar
*Riau*
RSU Arifin Ahmad Pekan Baru
RSU Kabupaten Karimun
RSU Tanjung Pinang RSU Puri Husada
RSU Dumai
*Kepulauan Riau*
RS Otorita Batam
*Jambi*
RSU Raden Mattaher Jambi
*Sumatera Selatan*
RSU Dr. M. Hoesin Palembang
RSU Lubuk Linggau
RSU Kayu Agung RSD Kabupaten Lahat
*Bangka Belitung*
RSU Tanjung Pandan
RSU Pangkal Pinang
*Bengkulu*
RSU Dr. M. Yunus Bengkulu
RSU Arga Makmur
RSU Manna
*Lampung*
RSU Abdul Moeloek
RSU Kalianda
RSU Mayjend HM Ryacudu
RSU Ahmad Yani
*DKI Jakarta*
RSPI Dr. Sulianti Saroso
RSU Persahabatan
RSPAD Gatot Subroto
*Jawa Barat*
RSU Dr. Hasan Sadikin Bandung
RSU Dr. Slamet Garut RSU Gunung Jati Cirebon RSTP Dr. H. A. Rotinsulu
Bandung
RSU R. Syamsudin, SH Sukabumi
RSU Indramayu
RSU Subang
*Banten*
RSU Serang RSU Tangerang
*Jawa Tengah*
RSU Dr. Kariadi Semarang;
RSU Dr. H. Soewondo
RSU Dr. Moewardi
RSU Banyumas
RSU Kudus
RSU Dr. H. RM. Soeselo W.
RSU Pekalongan
RSU Tidar RSU Prof. Dr. Margono Soekarjo
RSU Dr. Suraji Tirtonegoro
*DI Yogyakarta*
RSU Dr. Sardjito
RSU Panembahan Senopati Bantul
*Jawa Timur*
RSU Dr. Soetomo RSU Dr. Saiful
Anwar
RSU Dr. Soebandi
RS Dr. R. Koesma Tuban
RS Dr. S. Djatikoesoemo
RS Pare
RS Blambangan RS Dr. Soedono
*Bali*
RSU Sanglah
RSU Tabanan
RSU Sajiwani Gianyar
*Nusa Tenggara Barat*
RSU Mataram
RSU Raba
RSU Dr. R. Sudjono
RSU Praya
*Nusa Tenggara Timur*
RSU Prof. Dr. WZ Johanes
RSU Dr. TC Hillers
*Kalimantan Barat*
RSU Dr. Sudarso
RSU Dr. Abdul Aziz
RSU Sintang
*Kalimantan Tengah*
RSU Dr. Doris Sylvianus
RSU Dr. Murjani Sampit
*Kalimantan Selatan*
RSU Ulin RSU H. Boejasin
Pelaihari
*Kalimantan Timur*
RSU Tarakan RSU Dr. Kanujoso Djatiwibowo
RSU H. A. Wahab Sjahranie
RSU Kota Bontang RSU Panglima Sebaya
RSU Tanjung Selor
*Sulawesi Utara*
RSU Prof. DR. RD. Kandou
RSU Dr. Sam Ratulangi
*Gorontalo*
RSU Prof. Dr. H. Aloei Saboe
*Sulawesi Tengah*
RSU Undata RSU Luwuk RS Mokopido
Toli-Toli RSU Kolonedale
*Sulawesi Selatan*
RSU Dr. Wahidin Sudirohusodo
RSU Andi Makkasau
RSU Lakipadada Tana Toraja
RS Islam Faisal RS Akademis Jaury
RS Sinjai
*Sulawesi Tenggara*
RSU Kendari
*Maluku*
RSU Dr. M. Haulussy Ambon
*Maluku Utara*
RSU Chasan Basoeri Ternate
*Papua*
RSU Jayapura
Referensi: https://www.google.com/amp/s/amp.kompas.com
/tren/read/2020/01/30/133749365/menyebar-ke-18
-negara-berikut-100-rs-rujukan-pasien-virus-corona-di Terakhir diubah: 06:59
Posted by Drh.Pudjiatmoko,PhD at 13:27 0 comments
Labels: coronavirus
Surat dari Kelelawar untuk Umat Manusia
Surat dari Kelelawar untuk Umat Manusia untuk Cegah Wabah COVID-19
Saya bernama KELELAWAR dan saya memiliki sesuatu yang
sangat istimewa. Dalam diriku mengandung ribuan racun penyakit. Seperti virus
anjing gila super ganas, virus Ebola, virus Hendra, virus Nipah, virus Corona dan
berbagai virus-virus lain yang mematikan. Sumbangsihku kepada umat manusia adalah mengumpulkan
virus-virus ganas tersebut dalam diriku sebagai tempat berlindung, agar tidak
bertaburan di luar dan mengganggu kesehatan dan keselamatan umat manusia.
Saya menyadari di dalam tubuhku banyak mengandung mikroorganisme
yang sangat berbahaya terhadap manusia, maka saya rela bersedia tinggal di
lubang-lubang goa yang gelap dan dingin serta jauh dari tempat tinggal manusia.
Dengan mengandalkan kekuatan dan insting karunia Allah selama
puluhan ribu tahun, semua virus itu saya simpan dan kunci rapat-rapat. Ketika malam-malam
saya keluar dan subuh saya kembali untuk mencari makan agar trhindar kontak
dengan manusia. Bahkan dengan sengaja saya menampilkan wujud wajah seram dan
mengerikan, agar membuat manusia menjauhiku dan tidak menyentuhku.
Akan tetapi tidak pernah terbayangkan bahwa umat manusia
tidak dapat mengendalikan sifat serakahnya dan nafsu makannya. Wahai umat
manusia, tahukah kalian jika membuka kotak Pandora, maka seluruh virus petaka
akan berhamburan keluar menghujam ke tubuh kalian. Kalian bisa menjadikan aku
sebagai santapan yang lezat, tapi virus-virus yang bersemayam di tubuhku akan
kehilangan tempat tinggalnya. Virus-virus ini perlu mencari rumah baru bagi
mereka dan sel-sel tubuh kalian penuh dengan berbagai reseptor (tempat masuk
virus) yang cocok buat mereka. Mereka
masuk ke tubuhmu dan mereka nyaman bertempat tinggal di sel-sel tubuhmu.
Saya hanya bisa mengeluh dengan penuh penyesalan. Seluruh
jerih payah saya selama ini pada akhirnya semua dirusak. Saya hanya dapat
membantu manusia mengikuti Hukum Alam Semesta yang Allah ciptakan. Melindungi
hewan-hewan di alam semesta, sebenarnya bukan melindungi mereka, tapi justru
untuk melindungi umat manusia.
Saya ingin menyampaikan pesan yang mendalam bahwa kehidupan
manusia haruslah harmonis dengan alam. Manusia sebenarnya adalah mahkluk kecil
di dalam alam semesta ini. Janganlah manusia beranggapan bahwa dengan tercipta
sebagai manusia lalu tidak ada yang ditakuti, sehingga mengganggap diri yang
paling hebat dan berkuasa.
Hukum Alam sangat adil, saat engkau tidak menghargai
kehidupan mahkluk lainnya, dengan ulah tanganmu bencana dan malapetaka pasti
menghampirimu. Terakhir saya masih ingin mengingatkan kepada umat manusia,
bahwa surat ini tidak mewakili pribadi para Kelelawar, tapi mewakili juga para
Ular, Tikus, Burung-burung, Jangkrik, Belalang, Bintang Laut, Kuda laut dan
seluruh hewan di Alam semesta ini.
Referensi:
https://jarrak.id/sepucuk-surat-dari-kelelawar/
Posted by Drh.Pudjiatmoko,PhD at 10:52 0 comments
Labels: coronavirus
Subscribe to:
Posts (Atom)