Good Biosecurity Pratice pada Peternakan Babi

Munculnya pandemi H1N1 2009 (pH1N1) pada musim semi tahun 2009 menarik perhatian pada potensi ancaman virus yang terdapat pada hewan, dan memicu kekhawatiran internasional.  Manusia dipengaruhi oleh virus pandemi H1N1 2009. Selain babi, ada laporan tentang kalkun, musang, kucing dan anjing yang terinfeksi.

Dalam beberapa tahun terakhir, penyakit babi telah berdampak besar pada kesehatan manusia dan mata pencaharian masyarakat. Pengenalan demam babi Afrika ke Kaukasus, penyakit demam tinggi babi di Asia, dan wabah sebelumnya dari demam babi klasik dan penyakit kaki-mulut di Eropa dan Provinsi Taiwan di Cina memiliki semua dampak buruk pada ekonomi pertanian.

Wabah pandemi H1N1 2009 dan ketidakpastian awal tentang peran babi dalam menyebarkan virus memimpin Organisasi Pangan dan Pertanian Perserikatan Bangsa-Bangsa (FAO), Organisasi Dunia untuk Kesehatan Hewan (OIE) dan Bank Dunia untuk memberikan prioritas tertinggi kepada mengembangkan alat untuk meningkatkan biosekuriti dalam produksi babi. Prinsip-prinsip biosekuriti yang diuraikan dalam makalah ini berfungsi untuk membatasi penularan penyakit babi-ke-babi dan mengurangi dampak penyakit babi yang menular, termasuk kerugian ekonomi mereka. Prinsip-prinsip ini berasal langsung dari pengetahuan ilmiah tentang epidemiologi dan kunci penularan patogen babi.

Rute penularan penyakit pada babi

Salah satu rute penularan yang paling umum untuk agen infeksius adalah kontak langsung babi-ke-babi: perpindahan babi yang terinfeksi dalam kontak fisik yang dekat dengan babi yang tidak terinfeksi sangat menentukan dalam menularkan penyakit. Penularan penyakit melalui air mani yang terinfeksi didokumentasikan dengan baik. Peran orang dalam penularan penyakit telah dipelajari dengan seksama selama dekade terakhir: mereka dapat mengangkut patogen pada alas kaki, pakaian, tangan, dll. Orang dapat membawa virus pada mukosa hidung mereka (pembawa hidung) tanpa terinfeksi. Mereka juga dapat terinfeksi dan melepaskan patogen sebagai pembawa yang sehat atau sakit. Orang-orang juga menentukan pergerakan hewan dan produk domestik di antara ternak, pasar, dan wilayah. Kekuatan ekonomi dapat menyebabkan hewan dipindahkan dari jarak jauh, yang meningkatkan kemungkinan penyebaran penyakit secara geografis.

Kendaraan dan peralatan dapat berperan dalam menyebarkan penyakit. Penularan melalui udara lebih sulit untuk didokumentasikan, tetapi telah dipelajari secara eksperimental. Karena beberapa patogen dapat bertahan dalam limbah daging, perhatian khusus harus diberikan pada penggunaan limbah makanan dalam memberi makan babi. Pakan, air, dan tempat tidur semuanya dapat terkontaminasi dan berperan dalam menjaga penyakit. Kotoran dari babi yang terinfeksi dapat mengandung sejumlah besar virus, bakteri, atau parasit patogen: oleh karena itu penggunaan kotoran ternak di lahan pertanian dapat memasukkan patogen ke dalam rantai makanan dan ekosistem manusia, jika tidak diperhatikan selama penyimpanan dan penyebaran. Burung, tikus, anjing dan kucing liar, satwa liar dan babi liar, bersama dengan arthropoda, semuanya dapat menjadi pembawa potensial, baik melalui transmisi mekanis atau dengan terinfeksi.

Sistem produksi babi

Di sebagian besar negara, ada berbagai sistem produksi babi yang berbeda, dari yang paling sederhana, dengan investasi minimal, hingga perusahaan berorientasi pasar berskala besar. Makalah ini mengelompokkan sistem produksi babi ke dalam empat kategori, berdasarkan pada ukuran ternak, tujuan produksi dan manajemen peternakan:

 

• Memelihara babi scavenging adalah sistem tradisional yang paling dasar untuk memelihara babi dan yang paling umum dilaporkan di daerah perkotaan dan pedesaan di negara berkembang. Dalam sistem jarak bebas ini, babi berkeliaran dengan bebas di sekitar rumah tangga dan sekitarnya, mencari dan makan di jalan, dari tempat pembuangan sampah atau dari tanah tetangga atau hutan di sekitar desa. Beberapa pengaturan dibuat untuk menyediakan kandang bagi babi. Bergantung pada situasi setempat, babi mungkin dapat hidup bebas hampir sepanjang tahun dan ditulis selama musim hujan. Mereka mungkin ditempatkan di malam hari di tempat penampungan kecil, untuk melindungi mereka dari pencurian dan pemangsa. Memelihara babi pemulih membutuhkan input minimal dan investasi tenaga kerja rendah, tanpa uang atau investasi terbatas pada pakan terkonsentrasi atau vaksin.

 

• Produksi babi terbatas berskala kecil adalah umum di negara berkembang dan transisi. Babi terbatas pada tempat penampungan, yang bisa berkisar dari pena sederhana yang dibuat dengan bahan lokal hingga perumahan yang lebih modern. Babi-babi sepenuhnya bergantung pada pemelihara mereka untuk pakan, dan menerima cabang-cabang pohon, daun, sisa tanaman, produk sampingan pertanian atau pakan olahan. Petani kecil memelihara babi untuk alasan subsisten dan komersial. Daging babi dipasok ke pasar lokal dan ke pasar kota yang lebih jauh, melalui sistem pemasaran dan transportasi yang kompleks. Dalam sistem ini, risiko keuangan bagi produsen bisa tinggi dan ada dukungan terbatas dari organisasi dan badan profesional untuk input atau layanan teknis seperti asuransi.

 

• Peternakan komersial dalam skala besar produksi babi bervariasi dalam ukuran, tetapi umumnya jauh lebih besar daripada peternakan dalam kategori yang dijelaskan sebelumnya. Karena konsumen berusaha membeli makanan dengan harga terendah, tetapi harga input meningkat, margin laba per babi menurun. Produsen yang berpartisipasi dalam pasar daging babi komoditas global harus terus mengurangi biaya produksi per babi agar menguntungkan. Produksi dapat di satu situs saja atau di beberapa situs yang semuanya merupakan bagian dari struktur yang sama. Langkah-langkah pengurangan biaya utama yang dapat diterapkan ketika beralih dari produksi terbatas skala kecil ke skala besar adalah melalui peningkatan ukuran peternakan, spesialisasi kegiatan pertanian, konsolidasi langkah-langkah berbeda dari produksi babi, dan adopsi dari "semua-dalam- aliran produksi habis-habisan di setiap lokasi, dengan implementasi beberapa atau bahkan protokol biosekuriti yang ekstensif. Peternakan babi besar dapat dimiliki keluarga, berafiliasi dengan perusahaan atau dimiliki oleh perusahaan.

 

• Dalam produksi babi luar ruang skala besar, hewan dikurung pagar, tetapi umumnya di luar ruangan; Oleh karena itu, ada sedikit kebutuhan untuk investasi pada batu bata dan fasilitas mortar. Peternakan ini dapat memberi merek dan menjual daging babi dengan harga lebih tinggi, dan seringkali akan memiliki portofolio kegiatan yang lebih besar, termasuk agrowisata atau berburu misalnya.

 

Biosekuriti

Dalam makalah ini, biosecurity didefinisikan sebagai implementasi dari langkah-langkah yang mengurangi risiko agen penyakit diperkenalkan dan menyebar. Ini mensyaratkan bahwa orang mengadopsi seperangkat sikap dan perilaku untuk mengurangi risiko dalam semua kegiatan yang melibatkan hewan peliharaan, penangkaran / eksotis dan liar serta produk-produk mereka. Langkah-langkah biosekuriti harus digunakan untuk menghindari masuknya patogen ke dalam kawanan atau peternakan (biosecurity eksternal) dan untuk mencegah penyebaran penyakit ke hewan yang tidak terinfeksi dalam kawanan atau peternakan dan ke peternakan lain, ketika patogen sudah ada (biosecurity internal) . Makalah ini tidak menyajikan vaksinasi sebagai tindakan biosekuriti per se.

 

Berikut ini adalah tiga elemen utama biosekuriti:

1) Segregasi Pembuatan dan pemeliharaan hambatan untuk membatasi peluang potensial bagi hewan yang terinfeksi dan bahan yang terkontaminasi untuk memasuki tempat yang tidak terinfeksi. Bila diterapkan dengan benar, langkah ini akan mencegah sebagian besar kontaminasi dan infeksi.

2) Bahan Pembersih (mis., Kendaraan, peralatan) yang harus masuk (atau meninggalkan) suatu tempat harus dibersihkan secara menyeluruh untuk menghilangkan kotoran yang terlihat. Ini juga akan menghilangkan sebagian besar patogen yang mencemari bahan.

3) Disinfeksi Bila diterapkan dengan benar, desinfeksi akan menonaktifkan patogen apa pun yang ada pada bahan yang telah dibersihkan secara menyeluruh.

 

Dalam masing-masing dari ketiga elemen ini, langkah-langkah yang diambil untuk meningkatkan biosekuriti tergantung pada sistem produksi babi yang bersangkutan dan kondisi geografis dan sosial ekonomi setempat. Langkah-langkah pemisahan termasuk mengendalikan masuknya babi dari peternakan lain, pasar atau desa; menerapkan karantina untuk hewan yang baru dibeli; membatasi jumlah sumber stok pengganti; memagari daerah pertanian dan mengendalikan akses bagi orang-orang, serta burung, kelelawar, tikus, kucing dan anjing; menjaga jarak yang memadai antar peternakan; menyediakan alas kaki dan pakaian untuk dikenakan hanya di pertanian; dan menggunakan sistem manajemen habis-habisan. Langkah-langkah pembersihan dan desinfeksi mungkin melibatkan penggunaan mesin cuci tekanan tinggi dan tekanan rendah, dan akan diimplementasikan tidak hanya pada bangunan di lokasi, tetapi juga kendaraan, peralatan, pakaian, dan alas kaki.

 

Kesediaan untuk menerapkan langkah-langkah tersebut sangat tergantung pada kapasitas investasi dan status sosial dan ekonomi produsen dan pemangku kepentingan lainnya. Agar perubahan yang berarti terjadi di masyarakat pedesaan, mereka yang terlibat harus cukup memahami tentang pentingnya ekonomi produksi babi untuk penghidupan pemiliknya dan sumber daya utama yang memungkinkan langkah-langkah biosekuriti berkelanjutan yang tepat untuk dikembangkan; hal ini tergantung pada adanya rencana komunikasi yang dirancang dengan baik.

 

Best Practices (Penerapan Biosekuriti yang baik)

Implementasi langkah-langkah biosekuriti dalam memulung sistem produksi babi dibatasi oleh kapasitas terbatas produsen untuk menginvestasikan sumber daya dan waktu, dan oleh sifat memulung produksi babi. Namun, ada langkah-langkah sederhana yang dapat direkomendasikan dan yang terutama terkait dengan pemisahan: babi baru yang diperkenalkan ke desa harus bebas dari penyakit, dan perhatian khusus diperlukan ketika mereka dibeli dari pasar. Penggunaan karantina sangat penting. Ada juga kekhawatiran tentang babi betina dan babi hutan yang dipindahkan dari satu lokasi ke lokasi lain untuk kawin. Status kesehatan babi hutan perlu diketahui, khususnya mengenai penyakit yang menjadi perhatian. Ini adalah praktik umum bagi petani babi miskin untuk menjual hewan untuk disembelih segera setelah penyakit diduga. Pemasaran hewan yang sakit adalah risiko penyakit yang serius, karena babi yang menginkubasi atau mengeluarkan ini menyebarkan penyakit, terutama ketika mereka dijual di pasar hewan hidup. Praktik ini harus dicegah. Penggunaan babi yang tidak dirawat harus dihindari, dan sering dilarang oleh peraturan nasional. Dalam kasus kematian babi yang tidak biasa, layanan dokter hewan harus diinformasikan, sehingga tindakan segera dapat diambil untuk mengendalikan wabah penyakit; pembuangan bangkai yang benar dengan mengubur, membuat kompos atau membakar juga penting. Pembersihan hunian dan peralatan malam hari harus ditekankan. Disinfeksi tidak mungkin dilakukan.

 

Dalam skala kecil produksi babi, langkah-langkah akan fokus pada tiga elemen biosekuriti. Perbedaan penting antara produksi babi skala terbatas dan pemulung adalah bahwa kurungan memudahkan tindakan pemisahan. Langkah-langkah yang diusulkan untuk memulung babi juga berlaku untuk produksi babi berskala kecil. Babi yang baru dibeli harus disimpan selama minimal 30 hari di kandang karantina.

 

Dalam sistem ini, langkah-langkah tambahan dapat diperkenalkan. Lokasi peternakan babi dapat dikendalikan. Pemeliharaan yang dipisahkan berdasarkan usia harus didorong dan bangunan dirancang sedemikian rupa sehingga percampuran antar kelompok babi dengan status kesehatan yang berbeda dapat dengan mudah dihindari. Sistem manajemen all-in-out-out dimungkinkan. Pagar yang tepat dan langkah-langkah untuk mengontrol kontak dengan burung, tikus, kucing dan anjing dapat dipromosikan. Penting untuk mengembangkan protokol untuk tambak, yang harus dipatuhi oleh pengunjung dengan ketat; dengan babi yang dikurung, dimungkinkan untuk mengontrol akses untuk kendaraan dan orang-orang, termasuk pengemudi dan penyedia pakan. Pengunjung yang berwenang, terutama yang berurusan dengan babi - termasuk petani lain - harus diberi pakaian khusus dan alas kaki bersih oleh peternakan yang dikunjungi, dan harus mencuci tangan saat masuk. Semua instrumen atau peralatan yang mungkin bersentuhan dengan babi harus ditugaskan ke peternakan dan tetap bersih. Pentingnya pembersihan unit babi secara teratur dan menyeluruh sering kali tidak sepenuhnya dipahami: kotoran ternak harus dikeluarkan dari kandang setiap hari, kecuali ada lantai yang rata atau yang setara. Kontak dengan pupuk kandang, air seni dan jerami dari hewan yang sakit dan mati harus dihindari. Setelah dibersihkan, penggunaan disinfektan harus dipromosikan. Ketika sekelompok (batch) babi usia sama meninggalkan gedung, ruangan tersebut harus dibersihkan dan didisinfeksi dengan seksama. Kendaraan, terutama yang digunakan untuk mengangkut babi, harus dibersihkan dan didesinfeksi secara menyeluruh sebelum kembali ke atau mengunjungi peternakan lain. Teluk pemuatan babi yang aman akan membatasi pergerakan kendaraan di peternakan.

 

Dalam sistem produksi terbatas berskala besar, prinsip yang sama berlaku untuk sistem yang telah dibahas sebelumnya, tetapi dampak penyakit berpotensi lebih tinggi secara proporsional. Lokasi fisik ternak harus direncanakan untuk menjaga jarak yang memadai dari peternakan tetangga dan jalan yang sering digunakan. Untuk transmisi aerosol, aturan yang sama berlaku untuk sistem sebelumnya. Untuk unit di mana investasi yang signifikan dalam kesehatan ternak telah terjadi, penyaringan udara yang masuk kadang-kadang dilakukan dalam upaya untuk mengurangi risiko infeksi udara. Standar harus dikembangkan untuk pembelian bahan genetik yang masuk. Ketika mempraktikkan inseminasi buatan (AI), status kesehatan unit AI harus sesuai dengan kawanan penerima, dan protokol biosekuriti-nya harus memadai. 

 

Kontrol pengunjung dan fomites adalah fokus utama, karena keduanya dapat membawa patogen ke peternakan. Diperlukan pelatihan dan pemutakhiran staf oleh dokter hewan dan teknisi khusus dalam pengendalian penyakit. Sejumlah langkah dan teknik pengendalian penyakit kini tersedia untuk mengendalikan patogen yang relevan di pertanian komersial. Tantangan terbesar sering kali adalah memastikan implementasi praktik peternakan yang baik. Pemberantasan patogen secara progresif berkontribusi pada keamanan hayati regional dengan menurunkan risiko penyakit regional. Diikuti dengan kesimpulan logisnya, proses ini dapat menghasilkan pemberantasan penyakit dari wilayah atau negara.

 

Biosecurity untuk sistem produksi luar ruang skala besar perlu fokus pada kontrol bahan pakan, kontaminasi air dan padang rumput, satwa liar dan pengunjung manusia. Faktor-faktor lain seperti transportasi, fomites dan sumber stok berkembang biak juga perlu dipertimbangkan, karena risikonya sama seperti pada sistem produksi lainnya.

 

Perantara, penyedia layanan dan pengangkut adalah mata rantai utama di sepanjang rantai produksi dan pemasaran babi. Peran potensial mereka dalam penularan penyakit - tetapi juga sebagai juara untuk biosekuriti - adalah penting; karena itu mereka harus sepenuhnya terlibat dalam implementasi program biosekuriti.

 

Rumah pemotongan hewan adalah elemen penting lainnya dalam rantai pemasaran di mana ketiga elemen biosekuriti harus dilaksanakan, dengan fokus utama pada bio-containment.

 

Untuk mempertahankan status kesehatan yang tinggi di pusat AI, penting bahwa babi yang dibeli berstatus bebas penyakit. Penerapan skema jaminan kualitas di perusahaan-perusahaan ini harus menjadi prioritas.

 

Pasar hewan hidup adalah titik pencampuran yang jelas dan sumber penyebaran penyakit yang potensial: penahanan bio sangat penting di lokasi-lokasi ini, dan kontak di antara hewan-hewan dari berbagai asal harus dikontrol. Untuk membatasi risiko penyebaran penyakit, hewan yang belum dijual tidak boleh diperkenalkan kembali ke kawanan rumah tanpa masa karantina. Air limbah dan bubur perlu dikelola dengan baik. Namun, pasar tersebut juga merupakan lokasi yang berguna untuk menyebarkan dan mengumpulkan informasi.

 

Kesimpulan

Babi rentan terhadap berbagai penyakit yang memengaruhi produktivitas dan, secara de facto, pendapatan produsen - apakah ia produsen komersial skala besar atau hanya memiliki satu babi pemulung. Pandemi influenza 2009, yang disebabkan oleh strain baru H1N1 yang berasal dari babi, adalah pengingat tepat waktu dari risiko kesehatan manusia terkait dengan produksi ternak - ternak yang sama, termasuk babi, yang mendukung mata pencaharian dan ketahanan pangan hampir satu miliar orang kebanyakan dari mereka miskin.

 

Di antara solusi yang diperlukan untuk meminimalkan risiko penyebaran penyakit, penguatan biosecurity adalah prioritas. Ini tidak mengurangi kebutuhan akan rencana kesiapsiagaan yang tepat dan sumber daya yang memadai untuk mengendalikan berjangkitnya penyakit begitu terjadi, tetapi bersifat proaktif, memiliki dampak pencegahan dan memungkinkan produsen untuk melindungi aset mereka.

 

Pengetahuan menyeluruh tentang epidemiologi penyakit babi dan rute penularan penyakit telah memungkinkan pihak berwenang dan produsen untuk mengembangkan langkah-langkah biosekuriti yang memadai untuk sektor babi. Beberapa langkah-langkah ini berlaku di semua sistem produksi, sementara yang lain tidak. Setiap sistem produksi memerlukan langkah-langkah biosekuriti spesifik, dan meskipun pengambil keputusan tidak boleh berkompromi dengan kesehatan masyarakat, langkah-langkah untuk memperkuat biosekuriti dalam produksi babi harus mempertimbangkan kapasitas teknis dan finansial dari para pemangku kepentingan untuk mengimplementasikannya. Dampak sosial dan ekonomi dari penutupan pertanian yang tidak dapat memenuhi tingkat biosecurity yang disyaratkan juga harus dinilai dengan cermat.

 

Kunci untuk mengubah perilaku / praktik dalam kaitannya dengan peningkatan biosekuriti terletak pada persepsi risiko orang dan sumber daya yang tersedia di tingkat produksi. Agar perubahan yang berarti terjadi di masyarakat pedesaan, pendekatan holistik, multi-sektoral diperlukan untuk mengidentifikasi titik risiko kritis untuk penyebaran penyakit dan untuk memahami evolusi penyakit di lingkungan tertentu, dampak penyakit pada manusia, dan dampak yang dialami manusia. memiliki atau dapat memiliki penyakit. Promosi langkah-langkah biosekuriti berkelanjutan yang tepat berjalan seiring dengan penggunaan metodologi partisipatif dan strategi komunikasi yang dirancang dengan baik.

 

Upaya lebih lanjut diperlukan untuk menemukan keseimbangan yang tepat antara apa yang sektor swasta dapat dan akan secara sukarela implementasikan - berdasarkan rasio biaya / manfaat - dan persyaratan peraturan. Saling percaya antara sektor publik dan swasta sangat penting. Dalam kasus penyakit zoonosis, diskusi pre-emptive antara lembaga kesehatan masyarakat, departemen pertanian, layanan veteriner dan industri babi harus dilakukan untuk memastikan pemahaman bersama dan kerja sama yang baik untuk kepentingan masyarakat secara umum. Kolaborasi yang diperkuat antara layanan publik dan sektor swasta sangat penting untuk pengendalian penyakit yang lebih baik.

Coronavirus Novel 2019 (2019 nCoV) di China

Pada 31 Desember 2019, Kantor Negara WHO WHO diberitahu tentang kasus pneumonia etiologi yang tidak diketahui (penyebab tidak diketahui) terdeteksi di Kota Wuhan, Provinsi Hubei Cina. Virus corona baru (2019-nCoV) diidentifikasi sebagai virus penyebabnya oleh otoritas Cina pada 7 Januari. Virus corona merupakan zoonosis, artinya ditularkan antara hewan dan manusia dan merupakan keluarga besar virus yang menyebabkan penyakit mulai dari flu biasa hingga penyakit yang lebih parah.

Pada 19 Januari - novel coronavirus (2019 nCoV) dikonfirmasi dalam 61 orang di Wuhan, China dan 3 kasus yang diekspor (semua dari orang yang bepergian dari Wuhan, Cina) 2 orang dikonfirmasi di Thailand, dan 1 orang di Jepang. Pembaruan terakhir WHO adalah pada 17/1/20; pada 1/18/20

Komisi Kesehatan Masyarakat Wuhan melaporkan tambahan 17 kasus yang dikonfirmasi dengan timbulnya gejala sebelum 13/1/2013 yang belum tercermin di situs web WHO.

Media melaporkan ada kasus-kasus yang dicurigai di Shenzhen dan Shanghai, Cina. Nepal, Vietnam, Hong Kong, Singapura dan Taiwan memiliki / telah memiliki kasus-kasus yang dicurigai tetapi tidak ada yang dikonfirmasi pada saat ini. Ini adalah musim influenza dengan gejala serupa sehingga penting bagi negara-negara untuk mematuhi definisi kasus 2019 nCov dan mendapatkan konfirmasi laboratorium.

Banyak yang masih belum diketahui tentang nCoV pada saat ini (termasuk sumber virus dan prevalensi dalam populasi manusia), tetapi tampaknya itu tidak menyebar secara efisien dari orang ke orang dan bahwa tingkat fatalitas kasus rendah (2 kematian dari 61 kasus). Namun, kedua hal ini dapat berubah ketika lebih banyak informasi tersedia dan / atau virus bermutasi. Tidak jelas berapa banyak pasar di Wuhan dan hewan apa yang dijual di pasar yang membawa dan menyebarkan coronavirus baru. "Jika Anda tidak dapat menemukan sumber dan tidak dapat mengendalikan sumber virus, maka anda tidak dapat memadamkan api," kata David Hui, direktur Pusat Penyakit Menular Penyakit Menular Stanley Ho di Chinese University of Hong Kong, "lapor dalam New Artikel York Times hari ini.

Liburan Tahun Baru Imlek akan meningkatkan perjalanan di Cina - lebih dari 3 miliar perjalanan diperkirakan akan dilakukan selama 40 hari di seluruh China, mulai Selasa [21 Jan 2020], saat orang-orang pulang untuk merayakan bersama keluarga mereka yang bepergian lintas-wilayah (hingga 150 juta orang Cina akan bepergian di wilayah ini).

Penting untuk tetap waspada di Asia dan sekitarnya.

Gejala utamanya adalah demam dengan beberapa kasus mengalami kesulitan bernapas dan pneumonia. Banyak kasus yang dikonfirmasi memiliki kontak dengan pasar yang mencakup hewan hidup dan produk hewan. Virus ini terkait dengan SARS, tetapi berbeda dari virus SARS yang muncul di Cina selatan pada tahun 2002-2003 dan menyebar ke 26 negara. (Pada akhir pandemi, SARS telah menginfeksi lebih dari 8.000 orang dengan tingkat kematian sekitar 10%.

Rekomendasi standar untuk mencegah penyebaran infeksi termasuk mencuci tangan secara teratur, menutupi mulut dan hidung ketika batuk dan bersin, memasak daging dan telur dengan saksama. Hindari kontak dekat dengan siapa pun yang menunjukkan gejala penyakit pernapasan seperti batuk dan bersin.

WHO mendorong semua negara untuk meningkatkan pengawasan terhadap infeksi saluran pernapasan akut yang parah (SARI), untuk meninjau dengan cermat setiap pola yang tidak biasa dari kasus SARI atau radang paru-paru dan untuk memberi tahu WHO tentang setiap dugaan atau konfirmasi kasus infeksi dengan coronavirus baru. Negara-negara didorong untuk terus memperkuat kesiapsiagaan terhadap keadaan darurat kesehatan sejalan dengan Peraturan Kesehatan Internasional (2005).

Wabah Pneumonia Coronavirus Novel 2019 di China

Pneumonia adalah infeksi atau peradangan akut di jaringan paru yang disebabkan oleh berbagai mikroorganisme, seperti bakteri, virus, parasit, jamur, pajanan bahan kimia atau kerusakan fisik paru. Pneumonia dapat menyerang siapa aja, seperti anak-anak, remaja, dewasa muda dan lanjut usia, namun lebih banyak pada balita dan lanjut usia. Pneumonia dibagi menjadi tiga yaitu community acquired pneumonia (CAP) atau pneumonia komunitas, hospital acquired pneumonia (HAP) dan ventilator associated pneumonia (VAP), dibedakan berdasarkan darimana sumber infeksi dari pneumonia. Pneumonia yang sering terjadi dan dapat bersifat serius bahkan kematian yaitu pneumonia komunitas.

Angka kejadian pneumonia lebih sering terjadi di negara berkembang. Pneumonia menyerang sekitar 450 juta orang setiap tahunnya. Berdasarkan data RISKESDAS tahun 2018, prevalensi pneumonia berdasarkan diagnosis tenaga kesehatan yaitu sekitar 2% sedangkan tahun 2013 adalah 1,8%. Berdasarkan data Kemenkes 2014, Jumlah penderita pneumonia di Indonesia pada tahun 2013 berkisar antara 23%-27% dan kematian akibat pneumonia sebesar 1,19%. Tahun 2010 di Indonesia pneumonia termasuk dalam 10 besar penyakit rawat inap di rumah sakit dengan crude fatality rate (CFR) atau angka kematian penyakit tertentu pada periode waktu tertentu dibagi jumlah kasus adalah 7,6%. Menurut Profil Kesehatan Indonesia, pneumonia menyebabkan 15% kematian balita yaitu sekitar 922.000 balita tahun 2015. 

Dari tahun 2015- 2018 kasus pneumonia yang terkonfimasi pada anak-anak dibawah 5 tahun meningkat sekitar 500.000 per tahun, tercatat mencapai 505.331 pasien dengan 425 pasien meninggal. Dinas Kesehatan DKI Jakarta memperkirakan 43.309 kasus pneumonia atau radang paru pada balita selama tahun 2019.

Pada tanggal 31 Desember 2019, di Kota Wuhan Tiongkok dilaporkan adanya kasus-kasus pneumonia berat yang belum diketahui etiologinya. Awalnya terdapat 27 kasus kemudian meningkat menjadi 59 kasus, dengan usia, antara 12-59 tahun. Terdapat laporan kematian pertama terkait kasus pneumonia ini, pasien usia 61 tahun dengan penyakit penyerta yaitu penyakit liver kronis dan tumor abdomen atau perut. Dari 50 pasien lainnya yang sedang menjalani perawatan, dua pasien sudah dinyatakan boleh pulang dan tujuh pasien masih dalam kondisi yang serius.

Hasil pengkajian dipikirkan kemungkinan etiologi kasus-kasus ini terkait dengan Severe Acute Respiratory Infection (SARS) yang disebabkan Coronavirus dan pemah menimbulkan pandemi di dunia pada tahun 2003. Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) merilis jenis Betacoronavirus yang menjadi outbreak di Wuhan, terdapat 5 genom baru, yang berbeda dari SARS-coronavirus dan MERSCoronavirus. Coronavirus merupakan keluarga besar virus yang menyebabkan penyakit ringan sampai berat, seperti common cold atau pilek dan penyakit yang serius seperti MERS dan SARS. Beberapa coronavirus diketahui beredar diperedaran darah hewan.

Gejala yang muncul pada pneumonia ini diantaranya demam, lemas, batuk kering dan sesak atau kesulitan bernapas. Beberapa kondisi ditemukan lebih berat. Pada orang dengan lanjut usia atau memiliki penyakit penyerta lain, memiliki risiko lebih tinggi untuk memperberat kondisi. Metode transmisi dan masa inkubasi belum diketahui. Berdasarkan investigasi beberapa institusi di Wuhan, sebagian kasus terjadi pada orang yang bekerja di pasar ikan, akan tetapi belum ada bukti yang menunjukkan penularan dari manusia ke manusia.

Selain di Wuhan, beberapa Negara melaporkan kasus-kasus suspek serupa dengan di Wuhan yaitu di Singapura, Seoul, Thailand dan Hongkong. Di Singapura dan Bangkok terdapat penerbangan langsung dari Wuhan. WHO mengonfirmasi ada satu kasus di Thailand, terdeteksi virus baru yang berasal dari outbreak pneumonia di Tiongkok. Kasus tersebut merupakan traveler dari Wuhan, Tiongkok. Berdasarkan data United Nations Maret 2018, terdapat banyak negara atau tempat yang menjadi tujuan pengunjung dari Wuhan diantaranya Bangkok, Hong Kong, Tokyo, Singapura, Denpasar Bali, Macau, Dubai, Sydney dan masih banyak negara lainnya. Namun, WHO belum merekomendasikan secara spesifik untuk traveler atau restriksi perdagangan dengan Tiongkok. Saat ini WHO masih terus melakukan pengamatan.

Terdapat beberapa vaksin pneumonia yang ditujukan untuk mencegah pneumonia, namun tidak bisa mencegah pneumonia yang sedang outbreak saat ini.

Beberapa vaksin tersebut yaitu sebagai berikut.

• Vaksin Pneumokokus (atau PCV : Pneumococcal Conjugate Vaccine) Vaksin PCV13 (merek dagang Prevnar®) memberikan kekebalan terhadap 13 strain bakteri Streptococcus pneumoniae, yang paling sering menyebabkan penyakit pneumokokus pada manusia. Masa perlindungan sekitar 3 tahun. Vaksin PCV13 utamanya ditujukan kepada bayi dan anak di bawah usia 2 tahun.
• Vaksin Pneumokokus PPSV23 Vaksin PPSV23 (nama dagang Pneumovax 23®) memberikan proteksi terhadap 23 strain bakteri pneumokokus. Vaksin PPSV23 ditujukan kepada kelompok umur yang lebih dewasa. Mereka adalah orang dewasa usia 65 tahun ke atas, atau usia 2 hingga 64 tahun dengan kondisi khusus.
• Vaksin Hib Di negara berkembang, bakteri Haemophilus influenzae type B (Hib) merupakan penyebab pneumonia dan radang otak (meningitis) yang utama. Di Indonesia vaksinasi Hib telah masuk dalam program nasional imunisasi untuk bayi. Terkait pencegahan pneumonia yang sedang outbreak saat ini, belum ada vaksin untuk mencegah kasus ini karena pneumonia pada kasus outbreak saat ini disebabkan oleh coronavirus jenis baru.

Menyikapi hal ini, PDPI (Perhimpunan Dokter Paru Indonesia) menyarankan beberapa hal, antara lain:

1. Agar masyarakat jangan panik.

2. Masyarakat tetap waspada terutama bila mengalami gejala demam, batuk disertai kesulitan bernafas, segera mencari pertolongan ke RS terdekat.

3. Health Advice

• Melakukan kebersihan tangan rutin, terutama sebelum memegang mulut, hidung dan mata; serta setelah memegang instalasi publik.
• Mencuci tangan dengan air dan sabun cair serta bilas setidaknya 20 detik. Cuci dengan air dan keringkan dengan handuk atau kertas sekali pakai. Jika tidak ada fasilitas cuci tangan, dapat menggunakan alkohol 70-80% handrub.
• Menutup mulut dan hidung dengan tissue ketika bersin atau batuk.
• Ketika meiliki gejala saluran napas, gunakan masker dan berobat ke fasilitas layanan kesehatan.

4. Travel advice

• Hindari menyentuh hewan atau burung.
• Hindari mengunjungi pasar basah, peternakan atau pasar hewan hidup.
• Hindari kontak dekat dengan pasien yang memiliki gejala infeksi saluran napas.
• Patuhi petunjuk keamanan makanan dan aturan kebersihan.
• Jika merasa kesehatan tidak nyaman ketika di daerah outbreak terutama demam atau batuk, gunakan masker dan cari layanan kesehatan.
• Setelah kembali dari daerah outbreak, konsultasi ke dokter jika terdapat gejala demam atau gejala lain dan beritahu dokter riwayat perjalanan serta gunakan masker untuk mencegah penularan penyakit.

Sumber: Press release “Perhimpunan Dokter Paru Indonesia (PDPI) outbreak pneumonia di Tiongkok, Jakarta. 17 Januari 2020

Pengenalan Telomer

Telomer ( / ˈ t ɛ l ə m ɪ ə r / atau / ˈ t ɪ l ə m ɪ ə r / ) adalah bagian urutan nukleotida berulang pada setiap ujung kromosom, yang berfungsi melindungi ujung kromosom dari kerusakan. atau dari fusi dengan kromosom tetangga. Namanya berasal dari kata benda Yunani telos ( τέλος ) "ujung" dan mero (μέρος, root: μερ- ) "Bagian". Untuk vertebrata, urutan nukleotida dalam telomer adalah AGGGTT , ^[1] dengan untai DNA komplementer menjadi TCCCAA, dengan overhang TTAGGG untai tunggal. ^[2] Urutan TTAGGG ini diulang sekitar 2.500 kali pada manusia. ^[3] Pada manusia, panjang telomer rata-rata menurun dari sekitar 11 kilobase saat lahir ^[4] menjadi kurang dari 4 kilobase di usia tua, ^[5] dengan tingkat penurunan rata-rata lebih besar pada pria daripada wanita. ^[6]

Selama replikasi kromosom, enzim yang menggandakan DNA tidak dapat melanjutkan duplikasi mereka sampai ke ujung kromosom, sehingga dalam setiap duplikasi ujung kromosom memendek ^[7] (ini karena sintesis fragmen Okazaki membutuhkan primer RNA yang dilekatkan oleh primer RNA di depan untaian yang tertinggal). Telomer adalah buffer sekali pakai di ujung kromosom yang dipotong selama pembelahan sel; keberadaan telomer melindungi gen sebelahnya pada kromosom agar tidak terpotong. Telomer sendiri dilindungi oleh kompleks protein shelterin, serta oleh RNA yang dikodekan oleh DNA telomer ( TERRA ).  Seiring waktu, karena setiap pembelahan sel, ujung telomer menjadi lebih pendek. ^[8] Telomer diisi ulang oleh enzim, telomerase reverse transcriptase . ^[9]

Penemuan Pertama Kali

Pada awal 1970-an, ahli teori Rusia Alexei Olovnikov pertama kali mengakui bahwa kromosom tidak dapat sepenuhnya meniru tujuan mereka. Membangun ini, dan untuk mengakomodasi gagasan Leonard Hayflick tentang pembelahan sel somatik terbatas, Olovnikov berpendapat bahwa sekuen DNA hilang setiap kali sel bereplikasi sampai kehilangannya mencapai tingkat kritis, di mana pembelahan sel berakhir. ^[10]

Pada tahun 1975–1977, Elizabeth Blackburn, yang bekerja sebagai rekan pascadoktoral di Universitas Yale bersama Joseph G. Gall, menemukan sifat yang tidak biasa dari telomer, dengan sekuens DNA berulang yang sederhana yang menyusun ujung kromosom. ^[11] Blackburn, Carol Greider , dan Jack Szostak dianugerahi Hadiah Nobel 2009 untuk Fisiologi atau Kedokteran untuk penemuan bagaimana kromosom dilindungi oleh telomer dan enzim telomerase. ^[12]

Pada tahun 1983, Barbara McClintock , seorang ahli sitogenetika Amerika terkemuka dan wanita pertama yang menerima Hadiah Nobel dalam Fisiologi atau Kedokteran, menerima Hadiah Nobel karena mengamati bahwa kromosom yang tidak memiliki bagian ujung menjadi "lengket" dan menghipotesiskan keberadaan struktur khusus di ujung kromosom yang akan menjaga stabilitas kromosom. ^[13]

Alam dan fungsi

Struktur, fungsi dan biologi evolusioner

Telomer adalah sekuens nukleotida berulang yang terletak pada termini kromosom linier pada sebagian besar organisme eukariotik . Untuk vertebrata, urutan nukleotida dalam telomer adalah  T T G G G. ^[14] Kebanyakan prokariota, yang memiliki kromosom sirkuler dan bukan linier, tidak memiliki telomer. ^[15] Telomer mengkompensasi replikasi DNA semi-konservatif tidak lengkap pada ujung kromosom. ^[16] Kompleks protein yang dikenal sebagai shelterin berfungsi untuk melindungi ujung telomer agar tidak dikenali sebagai jeda untaian ganda dengan menghambat rekombinasi homolog (HR) dan non-homologous end join (NHEJ). ^{[17] [18] [19]}

Pada sebagian besar prokariota, kromosom berbentuk lingkaran dan karenanya tidak memiliki ujung untuk mengalami terminasi replikasi dini. Sebagian kecil kromosom bakteri (seperti yang ada pada Streptomyces , Agrobacterium , dan Borrelia ) adalah linier dan memiliki telomer, yang sangat berbeda dengan kromosom eukariotik dalam struktur dan fungsi. Struktur telomer bakteri yang diketahui berbentuk protein yang terikat pada ujung kromosom linier, atau loop hairpin dari DNA untai tunggal di ujung kromosom linier. ^[20]

Saat mereplikasi DNA, enzim replikasi DNA eukariotik (kompleks protein polimerase DNA ) tidak dapat mereplikasi urutan yang ada di ujung kromosom (atau lebih tepatnya serat kromatid ). Oleh karena itu, urutan dan informasi yang dibawanya dapat hilang. Inilah alasan mengapa telomer sangat penting dalam konteks pembelahan sel yang sukses: Mereka "membatasi" urutan akhir dan mereka sendiri tersesat dalam proses replikasi DNA. Tetapi sel memiliki enzim yang disebut telomerase, yang melakukan tugas menambahkan sekuens nukleotida berulang ke ujung DNA. Telomerase "mengisi ulang" the "telomere" cap. Pada sebagian besar organisme eukariotik multiseluler, telomerase hanya aktif dalam sel kuman , beberapa jenis sel punca seperti sel punca embrionik, dan sel darah putih tertentu. Telomerase dapat diaktifkan kembali dan telomer direset kembali ke keadaan embrionik dengan transfer nuklir sel somatik. ^[21] Pemendekan telomer secara stabil dengan setiap replikasi dalam sel somatik (tubuh) mungkin memiliki peran dalam penuaan dan dalam pencegahan kanker . ^[22] [23] Ini karena telomer bertindak sebagai semacam "fuse" waktu tunda, akhirnya kehabisan setelah sejumlah pembelahan sel dan mengakibatkan hilangnya informasi genetik vital akhirnya dari kromosom sel dengan pembelahan masa depan. . ^[24]

Panjang telomer sangat bervariasi di antara spesies, dari sekitar 300 pasangan basa dalam ragi ^[25] hingga banyak kilobase pada manusia, dan biasanya terdiri dari susunan pengulangan guanine- rich, pengulangan panjang pasangan enam hingga delapan basa. Telomer eukariotik biasanya berakhir dengan overhang 3-untai tunggal DNA , yang sangat penting untuk pemeliharaan dan pembatasan telomer. Banyak protein yang mengikat DNA telomer tunggal dan ganda. ^[26] Fungsi-fungsi ini dalam pemeliharaan dan pembatasan telomer. Telomer membentuk struktur loop besar yang disebut loop telomer, atau T-loop. Di sini, untai beruntai tunggal melingkar dalam lingkaran panjang, distabilkan oleh protein pengikat telomer . ^[27] Pada akhir T-loop, DNA telomer beruntai tunggal dipegang pada daerah DNA beruntai ganda oleh untai telomer yang mengganggu DNA heliks ganda, dan pasangan basa ke salah satu dari dua untai. Struktur triple-stranded ini disebut loop perpindahan atau D-loop. ^[28]

Peran dalam siklus sel

Pemendekan telomer pada manusia dapat menginduksi penuaan replikatif, yang menghambat pembelahan sel. Mekanisme ini muncul untuk mencegah ketidakstabilan genom dan perkembangan kanker pada sel-sel usia manusia dengan membatasi jumlah pembelahan sel. Namun, telomer yang diperpendek merusak fungsi kekebalan tubuh yang mungkin juga meningkatkan kerentanan kanker. ^[29] Jika telomere menjadi terlalu pendek, mereka memiliki potensi untuk dibuka dari struktur tertutup yang mereka duga. Sel dapat mendeteksi pembungkusan ini sebagai kerusakan DNA dan kemudian berhenti tumbuh, memasuki usia lanjut seluler ( penuaan ), atau memulai pemusnahan diri sel ( apoptosis ) yang diprogram tergantung pada latar belakang genetik sel (status p53 ). Telomer yang tidak tertutup juga menghasilkan fusi kromosom. Karena kerusakan ini tidak dapat diperbaiki dalam sel somatik normal, sel tersebut bahkan dapat menjadi apoptosis. Banyak penyakit terkait penuaan terkait dengan telomer yang pendek. Organ memburuk karena semakin banyak selnya yang mati atau memasuki penuaan seluler.

Shelterin

Pada ujung paling jauh dari telomer adalah bagian pasangan berpasir tunggal 300 pasangan, yang membentuk T-loop. Lingkaran ini dianalogikan dengan simpul, yang menstabilkan telomer, mencegah ujung telomer diakui sebagai titik istirahat oleh mesin perbaikan DNA. Jika sambungan non-homolog terjadi di ujung telomer, fusi kromosom akan terjadi. T-loop disatukan oleh beberapa protein, yang paling terkenal adalah TRF1, TRF2, POT1, TIN1, dan TIN2, secara kolektif disebut sebagai kompleks shelterin. Pada manusia, kompleks shelterin terdiri dari enam protein yang diidentifikasi sebagai TRF1, TRF2, TIN2, POT1, TPP1, dan RAP1. ^[17]

Pemendekan Telomer

Telomer memendek sebagian karena masalah replikasi akhir yang diperlihatkan selama replikasi DNA hanya pada eukariota . Karena replikasi DNA tidak dimulai di kedua ujung untai DNA, tetapi mulai di tengah, dan mengingat bahwa semua DNA polimerase yang diketahui membaca untai cetakan dalam arah 3 'ke 5', orang menemukan untai terdepan dan tertinggal pada untaian Molekul DNA direplikasi.

Pada untai terkemuka, DNA polimerase dapat membuat untai DNA komplementer tanpa kesulitan karena membaca untai cetakan dari 3 'hingga 5'. Namun, ada masalah terjadi ke arah lain pada untaian tertinggal. Untuk mengatasi hal ini, sekuens pendek RNA yang bertindak sebagai primer menempel pada untaian tertinggal di depan bagian inisiasi. DNA polimerase dapat memulai replikasi pada titik itu dan menuju akhir situs inisiasi. Ini menyebabkan pembentukan fragmen Okazaki . Lebih banyak primer RNA menempel lebih jauh pada untai DNA dan DNA polimerase datang dan terus membuat untai DNA baru.

Untai yang tertinggal selama replikasi DNA

Akhirnya, primer RNA terakhir menempel, dan DNA polimerase, RNA nuclease, dan DNA ligase datang untuk mengubah RNA (primer) menjadi DNA dan untuk menutup celah di antara fragmen Okazaki. Tetapi, untuk mengubah RNA menjadi DNA, harus ada untai DNA lain di depan primer RNA. Ini terjadi di semua situs untai tertinggal, tetapi itu tidak terjadi pada akhir di mana primer RNA terakhir terpasang. Pada akhirnya, RNA itu dihancurkan oleh enzim yang menurunkan RNA yang tersisa pada DNA. Dengan demikian, bagian dari telomer hilang selama setiap siklus replikasi pada ujung 5 'anak perempuan yang tertinggal.

Namun, penelitian tabung menunjukkan bahwa telomer sangat rentan terhadap stres oksidatif . Ada bukti bahwa kerusakan DNA yang dimediasi oleh stres oksidatif merupakan penentu penting pemendekan telomer. ^[30] Pemendekan telomer karena radikal bebas menjelaskan perbedaan antara perkiraan kehilangan per divisi karena masalah replikasi akhir (sekitar 20 bp) dan tingkat pemendekan telomer aktual (50-100 bp), dan memiliki dampak absolut yang lebih besar pada panjang telomer dari pemendekan yang disebabkan oleh masalah replikasi akhir. Studi berbasis populasi juga menunjukkan interaksi antara asupan anti-oksidan dan panjang telomer. Dalam Proyek Studi Kanker Payudara Long Island (LIBCSP), penulis menemukan peningkatan moderat dalam risiko kanker payudara di antara wanita dengan telomere terpendek dan rendahnya asupan beta karoten, vitamin C atau E. ^[31] Hasil ini ^[32] menunjukkan bahwa risiko kanker akibat pemendekan telomer dapat berinteraksi dengan mekanisme lain kerusakan DNA, khususnya stres oksidatif.

Pemendekan telomer dikaitkan dengan penuaan, kematian dan penyakit terkait penuaan. Penuaan normal dikaitkan dengan pemendekan telomer pada manusia dan tikus, dan studi pada model hewan yang dimodifikasi secara genetik menunjukkan hubungan sebab akibat antara erosi telomer dan penuaan. ^[33] Namun, tidak diketahui apakah telomer pendek hanya merupakan tanda usia seluler atau sebenarnya berkontribusi pada proses penuaan itu sendiri. ^[34]

Penelitian pada manusia menunjukkan bahwa usia seorang ayah berperan dalam panjangnya telomer anak, yang memiliki implikasi evolusi. Meskipun telomer leukosit memendek seiring bertambahnya usia, telomer sperma memanjang seiring bertambahnya usia. Telomer yang lebih pendek berteori untuk memaksakan biaya energi yang lebih rendah (karena replikasi yang lebih sedikit) tetapi juga memiliki biaya yang berkaitan dengan sistem kekebalan dan penuaan lainnya dan penyakit, sehingga efek usia ayah pada panjang telomer mungkin merupakan adaptasi untuk meningkatkan peluang yang anak akan cocok untuk lingkungan tempat mereka dilahirkan. ^[35] [36]

Stres psikologis dan pemendekan telomer

Sebuah meta-analisis 2017 dari 23 studi menemukan bahwa peningkatan stres psikologis yang dirasakan dikaitkan dengan penurunan yang sangat kecil dalam panjang telomer - meskipun ada juga bukti potensi publikasi, yang ketika diperhitungkan melemahkan efek ini dan membuatnya tidak signifikan. ^[32]

Memanjang

Sel rata-rata akan membelah antara 50 dan 70 kali sebelum kematian sel. Sel membelah telomer di ujung kromosom menjadi lebih kecil. Batas Hayflick adalah batas teoritis untuk berapa kali sel dapat membelah sampai telomer menjadi begitu pendek sehingga pembelahan dihambat dan sel memasuki penuaan.

Fenomena divisi seluler terbatas pertama kali diamati oleh Leonard Hayflick , dan sekarang disebut sebagai batas Hayflick . ^[37] [38] Penemuan signifikan kemudian dilakukan oleh sekelompok ilmuwan yang diorganisasikan di Geron Corporation oleh pendiri Geron, Michael D. West yang mengikatkan telomer dengan pemendekan dengan batas Hayflick. ^[39] Kloning komponen katalitik telomerase memungkinkan percobaan untuk menguji apakah ekspresi telomerase pada level yang cukup untuk mencegah pemendekan telomer mampu mengabadikan sel manusia. Telomerase didemonstrasikan dalam publikasi tahun 1998 di Science yang mampu memperpanjang umur sel, dan sekarang dikenal sebagai mampu mengabadikan sel somatik manusia. ^[40]

Menjadi jelas bahwa membalikkan pemendekan telomer melalui aktivasi sementara telomerase mungkin merupakan cara ampuh untuk memperlambat penuaan. Alasan bahwa ini akan memperpanjang hidup manusia adalah karena itu akan memperpanjang batas Hayflick. Tiga rute telah diusulkan untuk membalikkan pemendekan telomer: obat-obatan, terapi gen, atau penekanan metabolisme, yang disebut, mati suri / hibernasi. Sejauh ini ide-ide ini belum terbukti pada manusia, tetapi telah dibuktikan bahwa pemendekan telomer terbalik dalam hibernasi dan penuaan diperlambat (Turbill, et al. 2012 & 2013) dan bahwa hibernasi memperpanjang masa hidup (Lyman et al. 1981 ). Juga telah dibuktikan bahwa ekstensi telomer telah berhasil membalik beberapa tanda penuaan pada tikus laboratorium ^[41] [42] dan spesies cacing nematoda Caenorhabditis elegans . ^[43] Telah dihipotesiskan bahwa telomer yang lebih lama dan khususnya aktivasi telomerase dapat menyebabkan peningkatan kanker (misalnya Weinstein dan Ciszek, 2002). Namun, telomer yang lebih panjang mungkin juga melindungi terhadap kanker, karena telomer pendek berhubungan dengan kanker. Juga telah disarankan bahwa telomer yang lebih panjang dapat menyebabkan peningkatan konsumsi energi. ^[29]

Teknik untuk memperluas telomer dapat berguna untuk rekayasa jaringan, karena mereka mungkin mengizinkan sel mamalia sehat dan non-kanker dikultur dalam jumlah yang cukup besar untuk menjadi bahan rekayasa untuk perbaikan biomedis.

Dua penelitian terbaru tentang burung laut berumur panjang menunjukkan bahwa peran telomere masih jauh dari pemahaman. Pada tahun 2003, para ilmuwan mengamati bahwa telomer dari petrel badai Leach ( Oceanodroma leucorhoa ) tampaknya memanjang dengan usia kronologis, contoh pertama yang diamati dari perilaku telomer seperti itu. ^[44] Pada 2006, Juola et al. ^[45] melaporkan bahwa pada spesies burung laut lain yang tidak terkait dan berumur panjang, frigatebird besar ( Fregata minor ), panjang telomer berkurang hingga setidaknya c. Usia 40 tahun (yaitu mungkin sepanjang masa hidup), tetapi kecepatan penurunan melambat secara masif dengan bertambahnya usia, dan tingkat penurunan panjang telomer sangat bervariasi di antara masing-masing burung. Mereka menyimpulkan bahwa pada spesies ini (dan mungkin pada burung frigat dan kerabat mereka secara umum), panjang telomer tidak dapat digunakan untuk menentukan usia burung dengan cukup baik. Dengan demikian, tampaknya ada jauh lebih banyak variasi dalam perilaku panjang telomer daripada yang diyakini sebelumnya.

Selanjutnya, Gomes et al. menemukan, dalam sebuah studi tentang biologi perbandingan telomer mamalia, bahwa panjang telomer dari spesies mamalia yang berbeda berkorelasi terbalik, bukan secara langsung, dengan umur, dan mereka menyimpulkan bahwa kontribusi panjang telomer ke masa hidup masih kontroversial. ^[46] Harris et al. menemukan sedikit bukti bahwa, pada manusia, panjang telomer adalah biomarker signifikan dari penuaan normal sehubungan dengan kemampuan kognitif dan fisik yang penting. ^[47] Gilley dan Blackburn menguji apakah penuaan seluler di paramecium disebabkan oleh pemendekan telomer, dan menemukan bahwa telomer tidak dipersingkat selama penuaan. ^[48]

Urutan Nekluetida Telomer

Sekuen nukleotida telomer yang dikenal dan terkini tercantum dalam situs web Database Telomerase .

Beberapa sekuen nukleotida telomere dikenal
Kelompok	Organisme	Telomeric repeat (5 'hingga 3' menjelang akhir)
Vertebrata	Manusia , tikus , Xenopus	TTAGGG
Jamur berserat	Neurospora crassa	TTAGGG
Cetakan lendir	Physarum , Didymium	TTAGGG
	Dictyostelium	AG (1-8)
Protozoa Kinetoplastid	Trypanosoma , Crithidia	TTAGGG
Protozoa bersilia	Tetrahymena , Glaucoma	TTGGGG
	Paramecium	TTGGG (T / G)
	Oxytricha , Stylonychia , Euplotes	TTTTGGGG
Protozoa apicomplexan	Plasmodium	TTAGGG (T / C)
Tanaman yang lebih tinggi	Arabidopsis thaliana	TTTAGGG
	Cestrum elegans	TTTTTTAGGG [49]
	Allium	CTCGGTTATGGG [50]
Ganggang hijau	Chlamydomonas	TTTTAGGG
Serangga	Mori Bombyx	TTAGG
Cacing gelang	Ascaris lumbricoides	TTAGGC
Ragi fisi	Schizosaccharomyces pombe	TTAC (A) (C) G (1-8)
Ragi pemula	Saccharomyces cerevisiae	TGTGGGTGTGGTG (dari template RNA) atau G (2-3) (TG) (1-6) T (konsensus)
	Saccharomyces castellii	TCTGGGTG
	Candida glabrata	GGGGTCTGGGTGCTG
	Candida albicans	GGTGTACGGATGTCTAACTTCTT
	Candida tropicalis	GGTGTA [C / A] GGATGTCACGATCATT
	Candida maltosa	GGTGTACGGATGCAGACTCGCTT
	Candida guillermondii	GGTGTAC
	Candida pseudotropicalis	GGTGTACGGATTTGATTAGTTATGT
	Kluyveromyces lactis	GGTGTACGGATTTGATTAGGTATGT

Penelitian Risiko Penyakit

Telomer penting untuk menjaga integritas genom dan mungkin menjadi faktor untuk penyakit yang berkaitan dengan usia. ^[51] Studi laboratorium menunjukkan bahwa disfungsi atau pemendekan telomer umumnya didapat selama proses penuaan dan perkembangan tumor. ^[51] [52] Telomere pendek dapat menyebabkan ketidakstabilan genom, hilangnya kromosom, dan pembentukan translokasi non-resiprokal; dan telomer dalam sel tumor dan lesi prekursor mereka secara signifikan lebih pendek dari jaringan normal di sekitarnya. ^[53] [54]

Studi pengamatan telah menemukan telomer yang lebih pendek pada banyak jenis kanker eksperimental. ^[51] Selain itu, penderita kanker diketahui memiliki telomer leukosit yang lebih pendek daripada kontrol yang sehat. ^[55] Meta analisis terbaru menunjukkan 1,4 hingga 3,0 kali lipat peningkatan risiko kanker bagi mereka yang memiliki telomere terpendek vs terpanjang. ^[56] [57] Namun, peningkatan risiko bervariasi berdasarkan usia, jenis kelamin, jenis tumor, dan perbedaan faktor gaya hidup. ^[51]

Pengukuran

Beberapa teknik saat ini digunakan untuk menilai panjang telomer rata-rata dalam sel eukariotik. Salah satu metode adalah Terminal Restriction Fragment (TRF) Southern blot. ^[58] [59] Uji PCR Real-Time untuk panjang telomer melibatkan penentuan rasio Telomere-to-Single Copy Gene (T / S), yang ditunjukkan proporsional dengan panjang telomer rata-rata dalam sebuah sel. ^[60]

Sementara beberapa perusahaan menawarkan layanan pengukuran panjang telomer, kegunaan pengukuran ini untuk penggunaan klinis atau pribadi yang luas telah dipertanyakan. ^[61] [62] Pemenang Hadiah Nobel Elizabeth Blackburn , yang merupakan salah satu pendiri satu perusahaan, mempromosikan kegunaan klinis ukuran panjang telomer. ^[63]

Telomer Ectothermic

Sebagian besar penelitian tentang panjang dan regulasi telomer, dan hubungannya dengan kanker dan penuaan, telah dilakukan pada mamalia, terutama manusia, yang memiliki sedikit atau tanpa produksi telomerase somatik. Ectotherms secara signifikan lebih mungkin daripada variasi endotherms untuk memiliki variasi dalam ekspresi telomerase somatik. Misalnya, pada banyak ikan, telomerase terjadi di seluruh tubuh (dan terkait dengan ini, panjang telomer kira-kira sama di semua jaringannya). Studi tentang ektoterm, dan organisme non-mamalia lainnya, menunjukkan bahwa tidak ada satu model universal erosi telomer; sebaliknya, ada variasi luas dalam dinamika yang relevan di seluruh Metazoa, dan bahkan dalam kelompok taksonomi yang lebih kecil, pola-pola ini tampak beragam. Karena garis waktu reproduksi yang berbeda dari beberapa ektoterm, pemilihan penyakit lebih relevan untuk sebagian kecil dari kehidupan makhluk ini daripada mamalia, sehingga panjang telomer kehidupan awal dan akhir, dan kemungkinan hubungan mereka dengan kanker, tampaknya terutama penting dalam spesies ini dari sudut pandang teori sejarah kehidupan . ^[64]