Dua Domain NS1 pada Virus Flu Burung

Dengan menentukan struktur protein penting yang merupakan bagian dari virus influenza A, peneliti di Baylor College of Medicine telah menemukan petunjuk untuk menjelaskan virulensi virus dan juga bahaya yang ditimbulkan oleh strain terkini flu burung yang dapat menimbulkan kematian pada unggas dan beberapa orang di seluruh dunia.

Mutasi terjadi pada NS1

Protein - NS1 - memiliki dua bagian utama, yang disebut domain, kata BV Venkataram Prasad, Ph.D., profesor biokimia dan biologi molekuler di BCM.

Struktur satu – domain pengikat RNA beruntai ganda – yang telah ditemukan sebelumnya. Dia dan Zachary A. Bornholdt, seorang mahasiswa pascasarjana di Sekolah Pascasarjana Ilmu Biomedis BCM dan di laboratorium Prasad, menemukan struktur kedua, domain efektor.  

Dengan demikian, penemuan ini menunjukan bahwa beberapa mutasi atau perubahan dalam virus flu burung (H5N1) dapat terjadi pada protein ini dan dapat dipetakan pada strukturnya.

Secara khusus, kata Bornholdt, pada strain H5N1 baru-baru ini, NS1 memiliki delesi (penghapusan) materi genetik yang memotong wilayah linker, yang bisa memainkan peran dalam bagaimana dua bagian utama (domain) yang berbeda dari virus berinteraksi dengan molekul lain. Hubungan antara dua domain ini yang menyebabkan virulensi terlihat pada bentuk terbaru dari pada virus flu burung.

Menangkal respon kekebalan

NS1 sebenarnya menghalangi kemampuan sel untuk melindungi diri melalui sistem kekebalan tubuh.  "Mutasi (terlihat dalam versi dari virus avian influenza) memungkinkan virus untuk menangkal respon kekebalan lebih efisien," kata Prasad.

Prasad dan Bornholdt menekankan bahwa banyak dari apa yang mereka duga dari struktur ini bagian dari virus perlu diuji di laboratorium.

"Apa yang kami lakukan adalah menempatkan struktur ini di luar sana dan mengatakan bahwa ini adalah apa yang mungkin terjadi," kata Prasad. "Ini adalah proposal atau hipotesis."

Mengganggu Interaksi

Mengetahui di mana NS1 mengikat molekul penting tertentu dalam sel memungkinkan untuk merancang obat yang akan mengganggu interaksi itu, kata Prasad dan Bornholdt. Dengan demikian, kemampuan NS1 dalam menangkal respon kekebalan tubuh dapat diganggu atau dicegah.

Bornholdt mengatakan obat tertentu akan menguntungkan bagi pasien karena bisa menghentikan virus selama perjalanan penyakit. Obat harus diberikan pada awal infeksi sehingga efektif.

Para ilmuwan mengatakan karena banyak virus memiliki protein yang mirip dengan NS1 yang melayani fungsi yang sama, hal itu juga mengisyaratkan kemungkinan untuk merancang obat yang bisa mengganggu fungsi ini dalam virus yang berbeda.